More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4718 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
272 aa  533  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.22 
 
 
276 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.85 
 
 
274 aa  291  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.85 
 
 
274 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.48 
 
 
274 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.17 
 
 
270 aa  275  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.84 
 
 
273 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.47 
 
 
267 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.09 
 
 
267 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.27 
 
 
270 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.7 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.91 
 
 
279 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.31 
 
 
269 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.18 
 
 
272 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.43 
 
 
266 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.41 
 
 
270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.88 
 
 
270 aa  232  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.38 
 
 
275 aa  231  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.21 
 
 
272 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.55 
 
 
271 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.38 
 
 
281 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
272 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
272 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
272 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.25 
 
 
280 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.32 
 
 
272 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.32 
 
 
272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
269 aa  225  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
272 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 
269 aa  225  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  47.17 
 
 
289 aa  224  8e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
269 aa  225  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
269 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
269 aa  224  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
269 aa  224  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
269 aa  224  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  41.89 
 
 
269 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
269 aa  224  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
272 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 
276 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 
276 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.08 
 
 
272 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
269 aa  222  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
269 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
269 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
269 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
269 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
269 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.15 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.24 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.46 
 
 
272 aa  218  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
272 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 
274 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.42 
 
 
270 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.49 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.33 
 
 
264 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.98 
 
 
281 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.67 
 
 
276 aa  209  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
265 aa  208  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  44.24 
 
 
266 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.18 
 
 
267 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.85 
 
 
264 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.32 
 
 
270 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.28 
 
 
277 aa  205  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.11 
 
 
272 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.76 
 
 
260 aa  204  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.07 
 
 
271 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.42 
 
 
264 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.37 
 
 
260 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.4 
 
 
272 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.88 
 
 
271 aa  203  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.39 
 
 
270 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 
266 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.04 
 
 
275 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.1 
 
 
266 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.39 
 
 
270 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.23 
 
 
273 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  45.04 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.39 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 
279 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
285 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.01 
 
 
272 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.36 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.87 
 
 
276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.88 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
279 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
279 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
279 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 
266 aa  195  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1990  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 
268 aa  195  9e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307416  normal  0.0845217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>