More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3147 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  61.02 
 
 
847 aa  944    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  69 
 
 
813 aa  1104    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  100 
 
 
817 aa  1616    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  50.71 
 
 
878 aa  702    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  59.86 
 
 
840 aa  906    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  55.58 
 
 
810 aa  829    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  42.45 
 
 
394 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  41.97 
 
 
396 aa  270  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  41.08 
 
 
394 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
429 aa  263  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  45.98 
 
 
400 aa  260  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  39.64 
 
 
399 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.71 
 
 
431 aa  251  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  40.74 
 
 
393 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  45.77 
 
 
280 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  32.41 
 
 
441 aa  241  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  38.4 
 
 
407 aa  240  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  32.18 
 
 
441 aa  239  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.33 
 
 
443 aa  237  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  38.4 
 
 
412 aa  237  7e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  37.23 
 
 
397 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  45.45 
 
 
259 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  34.56 
 
 
428 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  36.38 
 
 
424 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  34.5 
 
 
431 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  38.68 
 
 
400 aa  234  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 
276 aa  234  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 
280 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
459 aa  232  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  43.92 
 
 
278 aa  230  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 
270 aa  230  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  40.98 
 
 
402 aa  229  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.64 
 
 
429 aa  228  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  47.06 
 
 
279 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
432 aa  226  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  34.49 
 
 
431 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  32.19 
 
 
433 aa  226  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  32.72 
 
 
428 aa  224  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  33.64 
 
 
427 aa  224  7e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.9 
 
 
433 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.9 
 
 
433 aa  223  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.9 
 
 
433 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.9 
 
 
433 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.96 
 
 
433 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  32.27 
 
 
433 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  42.32 
 
 
413 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  32.49 
 
 
433 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  45.53 
 
 
274 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  44.31 
 
 
277 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.97 
 
 
457 aa  221  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.95 
 
 
433 aa  220  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
277 aa  220  8.999999999999998e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  44.31 
 
 
277 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  38.93 
 
 
397 aa  219  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  42.03 
 
 
282 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 
282 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 
282 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 
282 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  42.03 
 
 
282 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 
282 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  35.42 
 
 
435 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 
282 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  35.42 
 
 
437 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 
282 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 
282 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  43.92 
 
 
277 aa  218  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 
282 aa  218  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 
282 aa  218  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 
282 aa  218  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 
282 aa  218  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  31.4 
 
 
422 aa  217  5.9999999999999996e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  43.14 
 
 
277 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  43.53 
 
 
282 aa  217  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  39.48 
 
 
286 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  31.51 
 
 
433 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.14 
 
 
433 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  30.22 
 
 
465 aa  216  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.51 
 
 
434 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  45.1 
 
 
282 aa  214  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  31.78 
 
 
429 aa  213  7.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
279 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  43.14 
 
 
277 aa  213  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
279 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  43.92 
 
 
277 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.19 
 
 
424 aa  213  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  35.54 
 
 
433 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  32.61 
 
 
451 aa  213  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  43.14 
 
 
277 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  43.53 
 
 
277 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 
285 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  43.53 
 
 
284 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  43.53 
 
 
277 aa  211  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  43.02 
 
 
279 aa  211  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  40.08 
 
 
277 aa  211  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  34.76 
 
 
440 aa  211  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  29.84 
 
 
428 aa  210  8e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 
275 aa  209  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  43.14 
 
 
277 aa  209  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  43.96 
 
 
290 aa  209  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  32.34 
 
 
404 aa  209  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>