39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1934 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1934  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  100 
 
 		 312 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  52.1 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  43.32 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  44.1 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0338  hypothetical protein  33.74 
 
 		 327 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  36.22 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.5 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6212  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  36.36 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3108  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  34.69 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1447  DMSO reductase chain C  34.69 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2049  hypothetical protein  34.69 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2340  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  34.69 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1358  hypothetical protein  34.69 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1074  hypothetical protein  34.69 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3223  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  34.38 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.12 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  34.77 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0057  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.43 
 
 		 327 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.58 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3813  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.75 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.97 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3994  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  36.45 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195622  normal  0.0360257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0858  hypothetical protein  35.53 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1799  DMSO reductase anchor subunit  30.95 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00050464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2644  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.92 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.022311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.97 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  26.87 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1384  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.34 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2898  putative anaerobic reductase component  38.46 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2680  putative anaerobic reductase component  38.46 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2767  putative anaerobic reductase component  38.46 
 
 		 269 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2723  putative dimethylsulfoxide reductase  38.46 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2786  putative dimethylsulfoxide reductase  38.46 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  30.68 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45 
 
 		 551 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2790  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.19 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0145436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  30.77 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1227  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  39.29 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.493563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0426  putative dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit  30.13 
 
 		 288 aa  42.7  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.905194  hitchhiker  0.00000175345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>