More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4200 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 336 aa  685    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  63.36 
 
 		 349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  51.91 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  50.7 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  48.86 
 
 		 362 aa  331  9e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  39.4 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  38.56 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  37.08 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  37.76 
 
 		 353 aa  222  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  36.89 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  36.94 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  37.2 
 
 		 362 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  36.9 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  36.86 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  35.64 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  35.64 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  36.56 
 
 		 344 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  38.24 
 
 		 366 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  36.2 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  35.91 
 
 		 346 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  36.09 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  36.02 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  35.4 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  32.96 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  33.43 
 
 		 357 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  33.85 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  35.64 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.65 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  36.47 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  33.65 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.65 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  34.23 
 
 		 379 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  34.23 
 
 		 372 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.7 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  31.99 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  34.06 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.7 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.76 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  35.69 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.68 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.76 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.39 
 
 		 316 aa  185  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  37.33 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  33.15 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.96 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.96 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  36.25 
 
 		 335 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  35.8 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  34.97 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.28 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  32.96 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  46.23 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  37.11 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  37.11 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  36.56 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  35.46 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  34.04 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  34.53 
 
 		 358 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  36.07 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  34.47 
 
 		 323 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  33.75 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  36.42 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  33.85 
 
 		 402 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  34.36 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  34.36 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  33.33 
 
 		 350 aa  175  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  33.74 
 
 		 423 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  38.66 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  34.19 
 
 		 369 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  34.06 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  34.47 
 
 		 406 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  32.39 
 
 		 361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  43.98 
 
 		 365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  35.14 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  35.55 
 
 		 360 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  34.8 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.3 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  30.77 
 
 		 406 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  33.93 
 
 		 353 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  33.44 
 
 		 416 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  44.23 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  43.22 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  30.9 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  35.84 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  35.8 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.31 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  33.8 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  32.29 
 
 		 417 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  33.75 
 
 		 394 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  33.87 
 
 		 408 aa  170  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  42.71 
 
 		 383 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  33.12 
 
 		 397 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  35.62 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.43 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  34.08 
 
 		 363 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  35.09 
 
 		 415 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  33.02 
 
 		 408 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  32.92 
 
 		 406 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.52 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  39.82 
 
 		 460 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>