15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0082 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0082  LmbE family protein  100 
 
 
250 aa  508  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  40.87 
 
 
269 aa  164  2e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  39.92 
 
 
263 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  40 
 
 
272 aa  140  2e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2808  LmbE family protein  35.06 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  36.64 
 
 
252 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2686  LmbE family protein  34.2 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2284  LmbE family protein  35.42 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0970807  normal  0.047773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2913  LmbE family protein  33.77 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.821813  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  34.39 
 
 
240 aa  85.1  1e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2070  hypothetical protein  28.96 
 
 
338 aa  53.5  3e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3426  LmbE family protein  33.76 
 
 
253 aa  52.4  6e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00141665  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3367  hypothetical protein  31.35 
 
 
248 aa  49.3  7e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0232623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  27.49 
 
 
233 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  33.33 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>