12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0031 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0031  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  668  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00551613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1546  hypothetical protein  40.15 
 
 
306 aa  175  1e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2490  hypothetical protein  40.53 
 
 
307 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05640  hypothetical protein  37.5 
 
 
328 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0208  hypothetical protein  36.12 
 
 
319 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.032861  hitchhiker  0.00393769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2493  hypothetical protein  29.82 
 
 
337 aa  110  4e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2348  hypothetical protein  29.66 
 
 
324 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.403946  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6446  hypothetical protein  30.99 
 
 
270 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5253  hypothetical protein  28.57 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402527  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2696  Bile acid:sodium symporter  43.3 
 
 
404 aa  66.6  6e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2423  hypothetical protein  26.61 
 
 
280 aa  59.3  9e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3718  hypothetical protein  38.1 
 
 
260 aa  52  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0734193  normal  0.0692801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>