More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1776 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  100 
 
 
335 aa  650    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3051  Rhodanese domain protein  59.19 
 
 
272 aa  297  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0410601  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  60.47 
 
 
310 aa  293  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.84 
 
 
285 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  54.91 
 
 
283 aa  262  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.16 
 
 
285 aa  228  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  48.39 
 
 
288 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  46.81 
 
 
291 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  50.76 
 
 
291 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  49.82 
 
 
285 aa  215  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  49.46 
 
 
276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.59 
 
 
276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  46.76 
 
 
278 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  48.2 
 
 
283 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.24 
 
 
278 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  48.88 
 
 
280 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  45.04 
 
 
279 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.6 
 
 
299 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.35 
 
 
287 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
276 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  48.73 
 
 
275 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  47.94 
 
 
289 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  48 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.94 
 
 
289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  46.62 
 
 
312 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  44.61 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  49.21 
 
 
272 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  45.59 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  45.02 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  40.93 
 
 
278 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  46.86 
 
 
270 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.07 
 
 
282 aa  195  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  45.15 
 
 
285 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  43.56 
 
 
281 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  40.65 
 
 
278 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  48.3 
 
 
289 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  43.92 
 
 
296 aa  192  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.3 
 
 
289 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.3 
 
 
289 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  41.13 
 
 
272 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  40.98 
 
 
272 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  48.15 
 
 
289 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.06 
 
 
280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  45.39 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.19 
 
 
289 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  44.28 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  46.67 
 
 
375 aa  189  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  46.3 
 
 
282 aa  189  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  43.61 
 
 
289 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  43.61 
 
 
289 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.9 
 
 
284 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  42.64 
 
 
289 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  43.61 
 
 
289 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  43.61 
 
 
289 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.61 
 
 
289 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.61 
 
 
289 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  43.61 
 
 
289 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  44.48 
 
 
297 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  46.92 
 
 
287 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  47.35 
 
 
282 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.64 
 
 
292 aa  185  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  47.17 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.06 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  44.4 
 
 
284 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  45.39 
 
 
285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  47.71 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  43.21 
 
 
284 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.91 
 
 
284 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  47.71 
 
 
288 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.59 
 
 
289 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  46.77 
 
 
627 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  48.3 
 
 
298 aa  180  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  47.69 
 
 
283 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  38.18 
 
 
277 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  38.18 
 
 
277 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43 
 
 
292 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  40.15 
 
 
276 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  38.85 
 
 
283 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.8 
 
 
284 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  37.82 
 
 
277 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  37.82 
 
 
277 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.99 
 
 
284 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  37.82 
 
 
277 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  41.85 
 
 
284 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  42.86 
 
 
284 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  42.91 
 
 
304 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  38.81 
 
 
274 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  38.81 
 
 
274 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.4 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  39.49 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.59 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.58 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  38.41 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1994  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.88 
 
 
286 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  37.45 
 
 
277 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 
276 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  37.82 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 
281 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>