125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1327 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1327  glutathionylspermidine synthase  100 
 
 
407 aa  822    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8737  glutathionylspermidine synthase  49 
 
 
393 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7051  glutathionylspermidine synthase  46.85 
 
 
386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2484  glutathionylspermidine synthase  47.86 
 
 
382 aa  315  7e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1573  glutathionylspermidine synthase  44.44 
 
 
401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0108547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3053  glutathionylspermidine synthase  44.39 
 
 
406 aa  309  5e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00288809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0115  glutathionylspermidine synthase  44.64 
 
 
387 aa  307  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2755  glutathionylspermidine synthase  44.14 
 
 
403 aa  306  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0039837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2241  glutathionylspermidine synthase  41.88 
 
 
373 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01240  glutathionylspermidine synthase  43.11 
 
 
388 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.636699  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3915  glutathionylspermidine synthase  43.1 
 
 
385 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402968  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4889  glutathionylspermidine synthase  40.46 
 
 
377 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2757  glutathionylspermidine synthase  42.75 
 
 
412 aa  273  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4275  glutathionylspermidine synthase  41.33 
 
 
386 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.747428  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2359  glutathionylspermidine synthase  40.35 
 
 
381 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94612  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0311  Trypanothione synthase  38.96 
 
 
386 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02910  predicted enzyme  39.75 
 
 
386 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0663  glutathionylspermidine synthase  39.75 
 
 
386 aa  260  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.553236  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02860  hypothetical protein  39.75 
 
 
386 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3215  glutathionylspermidine synthase family protein  39.75 
 
 
386 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3502  glutathionylspermidine synthase family protein  39.75 
 
 
386 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000151418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0660  glutathionylspermidine synthase  39.75 
 
 
386 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3332  glutathionylspermidine synthase family protein  39.75 
 
 
386 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3470  glutathionylspermidine synthase family protein  39.75 
 
 
386 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000295312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4351  glutathionylspermidine synthase family protein  39.75 
 
 
386 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00967413  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3446  glutathionylspermidine synthase  39.51 
 
 
387 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3439  glutathionylspermidine synthase  39.51 
 
 
387 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3374  glutathionylspermidine synthase  39.51 
 
 
387 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3369  glutathionylspermidine synthase  39.51 
 
 
387 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3541  glutathionylspermidine synthase  39.51 
 
 
387 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5551  glutathionylspermidine synthase  40.39 
 
 
385 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1876  glutathionylspermidine synthase  37.97 
 
 
375 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5279  glutathionylspermidine synthase  39.66 
 
 
385 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428801  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3621  glutathionylspermidine synthase  38.31 
 
 
386 aa  255  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4277  glutathionylspermidine synthase  42.72 
 
 
386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.124865 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0321  glutathionylspermidine synthase  39.05 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3450  glutathionylspermidine synthase  39.25 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5363  glutathionylspermidine synthetase  41.95 
 
 
384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0571  putative glutathionylspermidine synthase  38.57 
 
 
386 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0651  glutathionylspermidine synthase  38.57 
 
 
386 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5199  glutathionylspermidine synthase  41.87 
 
 
387 aa  250  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1405  glutathionylspermidine synthase  39.66 
 
 
385 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3779  glutathionylspermidine synthase  40.05 
 
 
386 aa  249  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.326667  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0287  hypothetical protein  38.33 
 
 
386 aa  249  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5565  glutathionylspermidine synthase  40.89 
 
 
384 aa  249  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1219  glutathionylspermidine synthase  36.87 
 
 
387 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6550  putative glutathionylspermidine synthase family protein  41.05 
 
 
386 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544489 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01335  putative glutathionylspermidine synthase  40.74 
 
 
385 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.971977  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5121  glutathionylspermidine synthase  41.28 
 
 
387 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01618  glutathionylspermidine synthase  36.6 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5405  glutathionylspermidine synthase  39.56 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500047  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4658  glutathionylspermidine synthase  40.64 
 
 
387 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.46187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003906  glutathionylspermidine synthase  37.67 
 
 
388 aa  242  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.763675  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3071  glutathionylspermidine synthase  37.71 
 
 
400 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.742359  normal  0.268432 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3426  hypothetical protein  37.47 
 
 
400 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5702  glutathionylspermidine synthase domain protein  36.32 
 
 
387 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.515802  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04053  predicted synthetase/amidase  36.32 
 
 
387 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3827  glutathionylspermidine synthase  36.32 
 
 
387 aa  219  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000494371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4657  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  36.32 
 
 
387 aa  219  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.717463 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02190  synthetase/amidase  36.97 
 
 
388 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4644  glutathionylspermidine synthase domain protein  35.88 
 
 
387 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3807  glutathionylspermidine synthase  36.05 
 
 
387 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4737  glutathionylspermidine synthase domain protein  35.88 
 
 
387 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461524  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3780  glutathionylspermidine synthase family protein  35.48 
 
 
385 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4794  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  35.62 
 
 
387 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4653  glutathionylspermidine synthase domain protein  35.62 
 
 
387 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4430  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  35.79 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4746  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  35.79 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.260545  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4773  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  35.36 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5048  glutathionylspermidine synthase  34.99 
 
 
385 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1698  glutathionylspermidine synthase  35.24 
 
 
385 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.231799  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1247  glutathionylspermidine synthase  37.03 
 
 
407 aa  212  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37102  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3591  hypothetical protein  35.61 
 
 
406 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.274003  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3849  glutathionylspermidine synthase  36.25 
 
 
392 aa  205  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4716  glutathionylspermidine synthase domain protein  32.35 
 
 
352 aa  179  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0396  glutathionylspermidine synthase family protein  33.61 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.338468  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0421  glutathionylspermidine synthase family protein  33.61 
 
 
389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1585  glutathionylspermidine synthase family protein  33.89 
 
 
389 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1661  glutathionylspermidine synthase family protein  32.33 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1553  glutathionylspermidine synthase family protein  32.59 
 
 
390 aa  157  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3045  glutathionylspermidine synthase  32.53 
 
 
391 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1541  glutathionylspermidine synthase family protein  32.39 
 
 
392 aa  155  9e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1647  glutathionylspermidine synthase subfamily protein  32.11 
 
 
393 aa  152  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0090  glutathionylspermidine synthase  32.42 
 
 
393 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5050  glutathionylspermidine synthase  33.52 
 
 
390 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1471  glutathionylspermidine synthase  30.27 
 
 
392 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2931  putative glutathionylspermidine synthase  28.94 
 
 
415 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2652  glutathionylspermidine synthetase  28.65 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2932  glutathionylspermidine synthase  28.37 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2724  glutathionylspermidine synthase  28.37 
 
 
415 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2978  putative glutathionylspermidine synthase  28.45 
 
 
415 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0622059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2675  glutathionylspermidine synthase  28.37 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.484737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2970  glutathionylspermidine synthase, putative  28.37 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129373  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0141  glutathionylspermidine synthetase  28.7 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.37139 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0028  glutathionylspermidine synthetase  27.57 
 
 
415 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0250819  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1235  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  25.8 
 
 
629 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.114299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3723  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  28.34 
 
 
642 aa  106  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0216  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  25.82 
 
 
625 aa  97.1  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1786  glutathionylspermidine synthase  25.76 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3393  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  25.64 
 
 
620 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>