123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1247 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1247  glutathionylspermidine synthase  100 
 
 		 407 aa  833    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3591  hypothetical protein  64.94 
 
 		 406 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.274003  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3426  hypothetical protein  64.2 
 
 		 400 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3071  glutathionylspermidine synthase  64.2 
 
 		 400 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.742359  normal  0.268432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1405  glutathionylspermidine synthase  50.61 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5405  glutathionylspermidine synthase  49.88 
 
 		 384 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4275  glutathionylspermidine synthase  46.45 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.747428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3621  glutathionylspermidine synthase  46.44 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0571  putative glutathionylspermidine synthase  46.21 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0651  glutathionylspermidine synthase  46.21 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0287  hypothetical protein  45.97 
 
 		 386 aa  364  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4658  glutathionylspermidine synthase  49.26 
 
 		 387 aa  364  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.46187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5565  glutathionylspermidine synthase  48.89 
 
 		 384 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0311  Trypanothione synthase  46.19 
 
 		 386 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5121  glutathionylspermidine synthase  49.51 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3779  glutathionylspermidine synthase  47.42 
 
 		 386 aa  363  4e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.326667  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5199  glutathionylspermidine synthase  50.25 
 
 		 387 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1219  glutathionylspermidine synthase  44.96 
 
 		 387 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4277  glutathionylspermidine synthase  50.86 
 
 		 386 aa  362  8e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.124865 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0321  glutathionylspermidine synthase  46.68 
 
 		 386 aa  362  9e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5551  glutathionylspermidine synthase  48.89 
 
 		 385 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6550  putative glutathionylspermidine synthase family protein  48.16 
 
 		 386 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544489 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5279  glutathionylspermidine synthase  48.4 
 
 		 385 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3915  glutathionylspermidine synthase  47.54 
 
 		 385 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5363  glutathionylspermidine synthetase  48.28 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3807  glutathionylspermidine synthase  44.96 
 
 		 387 aa  353  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5702  glutathionylspermidine synthase domain protein  44.96 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.515802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4657  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  45.21 
 
 		 387 aa  353  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3446  glutathionylspermidine synthase  43.9 
 
 		 387 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3439  glutathionylspermidine synthase  43.9 
 
 		 387 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3374  glutathionylspermidine synthase  43.9 
 
 		 387 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3369  glutathionylspermidine synthase  43.9 
 
 		 387 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3541  glutathionylspermidine synthase  43.9 
 
 		 387 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02190  synthetase/amidase  47.06 
 
 		 388 aa  352  5e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02910  predicted enzyme  43.77 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04053  predicted synthetase/amidase  44.96 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0663  glutathionylspermidine synthase  43.77 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.553236  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3215  glutathionylspermidine synthase family protein  43.77 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3502  glutathionylspermidine synthase family protein  43.77 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000151418  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02860  hypothetical protein  43.77 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0660  glutathionylspermidine synthase  43.77 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3827  glutathionylspermidine synthase  44.96 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000494371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3332  glutathionylspermidine synthase family protein  43.77 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3470  glutathionylspermidine synthase family protein  43.77 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000295312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4351  glutathionylspermidine synthase family protein  43.77 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00967413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01618  glutathionylspermidine synthase  43 
 
 		 388 aa  351  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4430  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  44.99 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4746  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  44.99 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.260545  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003906  glutathionylspermidine synthase  42.75 
 
 		 388 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.763675  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3450  glutathionylspermidine synthase  43.28 
 
 		 386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3849  glutathionylspermidine synthase  46.45 
 
 		 392 aa  343  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01335  putative glutathionylspermidine synthase  46.12 
 
 		 385 aa  342  5e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.971977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4644  glutathionylspermidine synthase domain protein  44.23 
 
 		 387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4794  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  44.23 
 
 		 387 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4653  glutathionylspermidine synthase domain protein  44.23 
 
 		 387 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4737  glutathionylspermidine synthase domain protein  43.98 
 
 		 387 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4773  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  43.98 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1698  glutathionylspermidine synthase  44.44 
 
 		 385 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.231799  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3780  glutathionylspermidine synthase family protein  43.95 
 
 		 385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5048  glutathionylspermidine synthase  43.77 
 
 		 385 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1876  glutathionylspermidine synthase  38.82 
 
 		 375 aa  296  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4889  glutathionylspermidine synthase  41.08 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4716  glutathionylspermidine synthase domain protein  39.31 
 
 		 352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2241  glutathionylspermidine synthase  40.15 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2484  glutathionylspermidine synthase  41.45 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0115  glutathionylspermidine synthase  38.52 
 
 		 387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01240  glutathionylspermidine synthase  40.91 
 
 		 388 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.636699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1573  glutathionylspermidine synthase  38.83 
 
 		 401 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0108547  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2359  glutathionylspermidine synthase  39.17 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7051  glutathionylspermidine synthase  39.14 
 
 		 386 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2757  glutathionylspermidine synthase  38.08 
 
 		 412 aa  236  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2755  glutathionylspermidine synthase  36.12 
 
 		 403 aa  223  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0039837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8737  glutathionylspermidine synthase  36.34 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3053  glutathionylspermidine synthase  34.37 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00288809  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1327  glutathionylspermidine synthase  37.03 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0090  glutathionylspermidine synthase  29.98 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346525  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1553  glutathionylspermidine synthase family protein  27.55 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1471  glutathionylspermidine synthase  27.4 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1585  glutathionylspermidine synthase family protein  28.98 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1647  glutathionylspermidine synthase subfamily protein  28.65 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0421  glutathionylspermidine synthase family protein  28.3 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0396  glutathionylspermidine synthase family protein  28.74 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.338468  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1541  glutathionylspermidine synthase family protein  26.86 
 
 		 392 aa  120  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3045  glutathionylspermidine synthase  29.35 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0629112 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0708  Glutathionylspermidine amidase  25.06 
 
 		 619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3455  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  25.06 
 
 		 619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0705  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  25.06 
 
 		 619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3274  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  25.06 
 
 		 619 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3415  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  25.06 
 
 		 619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4300  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  25.06 
 
 		 619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5050  glutathionylspermidine synthase  30.58 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.440506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02864  fused glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.82 
 
 		 619 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02813  hypothetical protein  24.82 
 
 		 619 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3723  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.94 
 
 		 642 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1661  glutathionylspermidine synthase family protein  26.4 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3168  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.82 
 
 		 619 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0216  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  25.86 
 
 		 625 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1235  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  27.25 
 
 		 629 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.114299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3392  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.11 
 
 		 618 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3486  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.11 
 
 		 618 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>