125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3780 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3780  glutathionylspermidine synthase family protein  100 
 
 
385 aa  795    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1698  glutathionylspermidine synthase  92.21 
 
 
385 aa  744    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.231799  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5048  glutathionylspermidine synthase  65.19 
 
 
385 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3849  glutathionylspermidine synthase  55.81 
 
 
392 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02190  synthetase/amidase  52.96 
 
 
388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5551  glutathionylspermidine synthase  48.57 
 
 
385 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3621  glutathionylspermidine synthase  48.84 
 
 
386 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1219  glutathionylspermidine synthase  48.06 
 
 
387 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5363  glutathionylspermidine synthetase  47.66 
 
 
384 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5279  glutathionylspermidine synthase  48.18 
 
 
385 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428801  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3915  glutathionylspermidine synthase  48.57 
 
 
385 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402968  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0571  putative glutathionylspermidine synthase  47.8 
 
 
386 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01618  glutathionylspermidine synthase  45.62 
 
 
388 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0651  glutathionylspermidine synthase  47.8 
 
 
386 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04053  predicted synthetase/amidase  48.05 
 
 
387 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3807  glutathionylspermidine synthase  48.31 
 
 
387 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4430  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  48.05 
 
 
387 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4746  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  48.05 
 
 
387 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.260545  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0287  hypothetical protein  47.55 
 
 
386 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3827  glutathionylspermidine synthase  48.05 
 
 
387 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000494371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3446  glutathionylspermidine synthase  47.42 
 
 
387 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3439  glutathionylspermidine synthase  47.42 
 
 
387 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3374  glutathionylspermidine synthase  47.42 
 
 
387 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3369  glutathionylspermidine synthase  47.42 
 
 
387 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3541  glutathionylspermidine synthase  47.42 
 
 
387 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003906  glutathionylspermidine synthase  45.99 
 
 
388 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.763675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0311  Trypanothione synthase  46.91 
 
 
386 aa  364  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5702  glutathionylspermidine synthase domain protein  48.05 
 
 
387 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.515802  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3779  glutathionylspermidine synthase  48.2 
 
 
386 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.326667  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4657  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  48.31 
 
 
387 aa  362  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.717463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3450  glutathionylspermidine synthase  46.65 
 
 
386 aa  362  6e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0321  glutathionylspermidine synthase  46.91 
 
 
386 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02910  predicted enzyme  46.13 
 
 
386 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0663  glutathionylspermidine synthase  46.13 
 
 
386 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.553236  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02860  hypothetical protein  46.13 
 
 
386 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3215  glutathionylspermidine synthase family protein  46.13 
 
 
386 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3502  glutathionylspermidine synthase family protein  46.13 
 
 
386 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000151418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0660  glutathionylspermidine synthase  46.13 
 
 
386 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3332  glutathionylspermidine synthase family protein  46.13 
 
 
386 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3470  glutathionylspermidine synthase family protein  46.13 
 
 
386 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000295312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4351  glutathionylspermidine synthase family protein  46.13 
 
 
386 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00967413  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4737  glutathionylspermidine synthase domain protein  47.79 
 
 
387 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461524  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4773  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  47.79 
 
 
387 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4794  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  47.79 
 
 
387 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4653  glutathionylspermidine synthase domain protein  47.79 
 
 
387 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4644  glutathionylspermidine synthase domain protein  47.53 
 
 
387 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4275  glutathionylspermidine synthase  45.74 
 
 
386 aa  355  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.747428  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6550  putative glutathionylspermidine synthase family protein  45.34 
 
 
386 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1405  glutathionylspermidine synthase  45.71 
 
 
385 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01335  putative glutathionylspermidine synthase  45.45 
 
 
385 aa  349  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.971977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5405  glutathionylspermidine synthase  45.31 
 
 
384 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500047  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3426  hypothetical protein  45.06 
 
 
400 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3071  glutathionylspermidine synthase  45.06 
 
 
400 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.742359  normal  0.268432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4277  glutathionylspermidine synthase  46.35 
 
 
386 aa  343  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.124865 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3591  hypothetical protein  45.57 
 
 
406 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.274003  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5565  glutathionylspermidine synthase  44.16 
 
 
384 aa  342  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4658  glutathionylspermidine synthase  44.01 
 
 
387 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.46187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5121  glutathionylspermidine synthase  43.75 
 
 
387 aa  328  9e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1247  glutathionylspermidine synthase  43.95 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37102  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5199  glutathionylspermidine synthase  43.23 
 
 
387 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4716  glutathionylspermidine synthase domain protein  42.86 
 
 
352 aa  307  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1876  glutathionylspermidine synthase  42.19 
 
 
375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4889  glutathionylspermidine synthase  43.41 
 
 
377 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2241  glutathionylspermidine synthase  40.31 
 
 
373 aa  286  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1573  glutathionylspermidine synthase  40.15 
 
 
401 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0108547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2484  glutathionylspermidine synthase  39.59 
 
 
382 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0115  glutathionylspermidine synthase  38.87 
 
 
387 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2359  glutathionylspermidine synthase  35.71 
 
 
381 aa  249  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01240  glutathionylspermidine synthase  37.28 
 
 
388 aa  242  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.636699  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7051  glutathionylspermidine synthase  36.87 
 
 
386 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2755  glutathionylspermidine synthase  37.25 
 
 
403 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0039837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3053  glutathionylspermidine synthase  36.43 
 
 
406 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00288809  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2757  glutathionylspermidine synthase  35.91 
 
 
412 aa  223  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8737  glutathionylspermidine synthase  36.21 
 
 
393 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1327  glutathionylspermidine synthase  35.48 
 
 
407 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1553  glutathionylspermidine synthase family protein  29.53 
 
 
390 aa  143  5e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1585  glutathionylspermidine synthase family protein  29.87 
 
 
389 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0396  glutathionylspermidine synthase family protein  30.13 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.338468  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0421  glutathionylspermidine synthase family protein  29.87 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1647  glutathionylspermidine synthase subfamily protein  28.35 
 
 
393 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0090  glutathionylspermidine synthase  29.6 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346525  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1661  glutathionylspermidine synthase family protein  28.98 
 
 
391 aa  126  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02864  fused glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  27.11 
 
 
619 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02813  hypothetical protein  27.11 
 
 
619 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3168  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  27.11 
 
 
619 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3393  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.92 
 
 
620 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0708  Glutathionylspermidine amidase  26.84 
 
 
619 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3455  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.84 
 
 
619 aa  119  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0705  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.84 
 
 
619 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3274  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.84 
 
 
619 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3415  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.84 
 
 
619 aa  119  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4300  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.84 
 
 
619 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1541  glutathionylspermidine synthase family protein  27.52 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1471  glutathionylspermidine synthase  28.5 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3392  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.58 
 
 
618 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.560331  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3386  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.58 
 
 
618 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.696441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3321  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.58 
 
 
618 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0646215  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3312  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.58 
 
 
618 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193053  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3486  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.58 
 
 
618 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5050  glutathionylspermidine synthase  31.36 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.440506 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>