125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1219 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1219  glutathionylspermidine synthase  100 
 
 		 387 aa  810    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01335  putative glutathionylspermidine synthase  67.01 
 
 		 385 aa  532  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.971977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003906  glutathionylspermidine synthase  60.98 
 
 		 388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.763675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01618  glutathionylspermidine synthase  59.17 
 
 		 388 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4275  glutathionylspermidine synthase  60.15 
 
 		 386 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.747428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0311  Trypanothione synthase  61.24 
 
 		 386 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02910  predicted enzyme  58.91 
 
 		 386 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0663  glutathionylspermidine synthase  58.91 
 
 		 386 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.553236  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0321  glutathionylspermidine synthase  60.47 
 
 		 386 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02860  hypothetical protein  58.91 
 
 		 386 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3215  glutathionylspermidine synthase family protein  58.91 
 
 		 386 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3502  glutathionylspermidine synthase family protein  58.91 
 
 		 386 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000151418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0660  glutathionylspermidine synthase  58.91 
 
 		 386 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3332  glutathionylspermidine synthase family protein  58.91 
 
 		 386 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3470  glutathionylspermidine synthase family protein  58.91 
 
 		 386 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000295312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3446  glutathionylspermidine synthase  59.02 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3439  glutathionylspermidine synthase  59.02 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3374  glutathionylspermidine synthase  59.02 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3369  glutathionylspermidine synthase  59.02 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3541  glutathionylspermidine synthase  59.02 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4351  glutathionylspermidine synthase family protein  58.91 
 
 		 386 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00967413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3621  glutathionylspermidine synthase  59.95 
 
 		 386 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3450  glutathionylspermidine synthase  58.4 
 
 		 386 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0571  putative glutathionylspermidine synthase  59.17 
 
 		 386 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0651  glutathionylspermidine synthase  59.17 
 
 		 386 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0287  hypothetical protein  58.66 
 
 		 386 aa  484  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3779  glutathionylspermidine synthase  59.43 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.326667  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04053  predicted synthetase/amidase  52.06 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3807  glutathionylspermidine synthase  52.06 
 
 		 387 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4430  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  52.32 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3827  glutathionylspermidine synthase  52.06 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000494371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4657  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  52.58 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5702  glutathionylspermidine synthase domain protein  52.32 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.515802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4746  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  52.06 
 
 		 387 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.260545  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4644  glutathionylspermidine synthase domain protein  51.55 
 
 		 387 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4737  glutathionylspermidine synthase domain protein  50.77 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4794  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  51.03 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4653  glutathionylspermidine synthase domain protein  51.03 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4773  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  50.77 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3915  glutathionylspermidine synthase  48.45 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5565  glutathionylspermidine synthase  47.68 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6550  putative glutathionylspermidine synthase family protein  49.36 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5405  glutathionylspermidine synthase  47.8 
 
 		 384 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02190  synthetase/amidase  50.13 
 
 		 388 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4277  glutathionylspermidine synthase  49.35 
 
 		 386 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.124865 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3849  glutathionylspermidine synthase  49.1 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1698  glutathionylspermidine synthase  47.8 
 
 		 385 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.231799  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5279  glutathionylspermidine synthase  46.25 
 
 		 385 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5551  glutathionylspermidine synthase  46.51 
 
 		 385 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3780  glutathionylspermidine synthase family protein  48.06 
 
 		 385 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5048  glutathionylspermidine synthase  48.32 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1405  glutathionylspermidine synthase  47.55 
 
 		 385 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3591  hypothetical protein  44.72 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.274003  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4658  glutathionylspermidine synthase  46.51 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.46187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5199  glutathionylspermidine synthase  45.99 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5121  glutathionylspermidine synthase  46.77 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4716  glutathionylspermidine synthase domain protein  46.39 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5363  glutathionylspermidine synthetase  45.22 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1247  glutathionylspermidine synthase  44.96 
 
 		 407 aa  362  7.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3426  hypothetical protein  43.97 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3071  glutathionylspermidine synthase  43.22 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.742359  normal  0.268432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4889  glutathionylspermidine synthase  43.81 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2484  glutathionylspermidine synthase  42.89 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1876  glutathionylspermidine synthase  43.64 
 
 		 375 aa  312  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1573  glutathionylspermidine synthase  41.6 
 
 		 401 aa  300  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0108547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2241  glutathionylspermidine synthase  40.46 
 
 		 373 aa  295  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0115  glutathionylspermidine synthase  41.73 
 
 		 387 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2359  glutathionylspermidine synthase  39.64 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01240  glutathionylspermidine synthase  41.56 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.636699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7051  glutathionylspermidine synthase  39.95 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8737  glutathionylspermidine synthase  37.81 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1327  glutathionylspermidine synthase  36.87 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3053  glutathionylspermidine synthase  36.52 
 
 		 406 aa  242  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00288809  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2757  glutathionylspermidine synthase  34.91 
 
 		 412 aa  239  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2755  glutathionylspermidine synthase  36.27 
 
 		 403 aa  239  9e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0039837 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0090  glutathionylspermidine synthase  32.4 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346525  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0421  glutathionylspermidine synthase family protein  29.94 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1585  glutathionylspermidine synthase family protein  29.38 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0396  glutathionylspermidine synthase family protein  29.66 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.338468  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1471  glutathionylspermidine synthase  28.75 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3723  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  30.43 
 
 		 642 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1553  glutathionylspermidine synthase family protein  28.5 
 
 		 390 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1661  glutathionylspermidine synthase family protein  28.45 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02864  fused glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.89 
 
 		 619 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3168  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.89 
 
 		 619 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02813  hypothetical protein  26.89 
 
 		 619 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1541  glutathionylspermidine synthase family protein  27.81 
 
 		 392 aa  126  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0708  Glutathionylspermidine amidase  26.89 
 
 		 619 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3455  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.89 
 
 		 619 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0705  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.89 
 
 		 619 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3274  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.89 
 
 		 619 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3415  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.89 
 
 		 619 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4300  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.89 
 
 		 619 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3386  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  27.37 
 
 		 618 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.696441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3321  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  27.37 
 
 		 618 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0646215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3312  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  27.37 
 
 		 618 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193053  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3392  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  27.37 
 
 		 618 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3486  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  27.37 
 
 		 618 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1647  glutathionylspermidine synthase subfamily protein  30.03 
 
 		 393 aa  119  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3393  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  27.82 
 
 		 620 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>