224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0636 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0636  putative transcriptional acitvator, Baf family  100 
 
 		 273 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  55.38 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  54.23 
 
 		 250 aa  265  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  52.67 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  53.9 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4278  Baf family transcriptional activator  54.96 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  50.93 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  53.79 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  55.43 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4713  Baf family transcriptional activator  54.2 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.073438  hitchhiker  0.000383315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  55.35 
 
 		 268 aa  242  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  50 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  48.51 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  48.3 
 
 		 258 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.84 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  50.18 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5362  pantothenate kinase  47.97 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331999  normal  0.0497904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0569  putative transcriptional acitvator, Baf family  49.31 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  44.7 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  43.02 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  43.94 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  40.91 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.97 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  41.51 
 
 		 254 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  46.82 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  40.15 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  41.51 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4760  pantothenate kinase  48.71 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4846  pantothenate kinase  48.71 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5146  pantothenate kinase  48.71 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0464  pantothenate kinase  49.05 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  42.11 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.01 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  42.8 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  39.02 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1426  pantothenate kinase  47.29 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  38.87 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  36.84 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  36.84 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.05 
 
 		 254 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  45.45 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  45.45 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13632  pantothenate kinase  48.51 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.3574e-61  normal  0.0267284 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  37.5 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  38.87 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  38.64 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  44.11 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  45.08 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  39.02 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  43.02 
 
 		 254 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  37.87 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  37.87 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  37.87 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  37.87 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  37.87 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  37.87 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  37.87 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  38.24 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  42.05 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  37.88 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  37.87 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  40.91 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  38.87 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  38.81 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  44.74 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  39.64 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  39.85 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  40.91 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  40.98 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  38.87 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  41.22 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  41.29 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  41.89 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  41.35 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  40.44 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  37.74 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  37.12 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  41.89 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  37.12 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  41.6 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  38.46 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  39.62 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1220  putative transcriptional acitvator, Baf family  36.06 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  39.85 
 
 		 257 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  40.75 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2865  putative transcriptional acitvator, Baf family  43.61 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.07 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  39.47 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  39.47 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0762  pantothenate kinase  39.25 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  39.53 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1907  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.44 
 
 		 270 aa  155  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  39.33 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  37.21 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  37.96 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  36.88 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  40.3 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  36.3 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>