18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1051 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  40.34 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  0.0000000000000580905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  36.97 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  32.23 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0688  hypothetical protein  30.51 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1113  hypothetical protein  32.41 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  26.73 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  33.64 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  31.51 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  30.83 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41590  hypothetical protein  28.99 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1083  hypothetical protein  25.86 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2353  hypothetical protein  31.94 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0030  hypothetical protein  33.73 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  29.11 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  31.43 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  31.67 
 
 		 123 aa  41.2  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>