67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0033 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3344  hypothetical protein  81.52 
 
 		 767 aa  1298    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0033  putative serine protein kinase, PrkA  100 
 
 		 754 aa  1559    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0240  putative serine protein kinase, PrkA  62.23 
 
 		 762 aa  1009    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.277133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4311  putative serine protein kinase, PrkA  73.67 
 
 		 770 aa  1177    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0256  putative serine protein kinase, PrkA  62.5 
 
 		 762 aa  1013    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1721  putative serine protein kinase, PrkA  62.86 
 
 		 763 aa  1006    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2537  putative serine protein kinase, PrkA  23.89 
 
 		 690 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1379  putative serine protein kinase, PrkA  24.81 
 
 		 692 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3529  putative serine protein kinase, PrkA  24.32 
 
 		 692 aa  97.4  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.585407  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2729  putative serine protein kinase, PrkA  23.89 
 
 		 690 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2210  putative serine protein kinase, PrkA  24.31 
 
 		 694 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1230  putative serine protein kinase, PrkA  24.23 
 
 		 690 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2635  putative serine protein kinase, PrkA  23.89 
 
 		 690 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4656  putative serine protein kinase, PrkA  23.31 
 
 		 681 aa  96.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4175  putative serine protein kinase, PrkA  24.22 
 
 		 692 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170003  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1821  putative serine protein kinase, PrkA  25.78 
 
 		 709 aa  93.2  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0916843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0510  putative serine protein kinase, PrkA  22.46 
 
 		 630 aa  69.3  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3006  putative serine protein kinase, PrkA  22.41 
 
 		 633 aa  65.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223622  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0412  putative serine protein kinase, PrkA  23.24 
 
 		 690 aa  64.7  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34499  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2231  putative serine protein kinase, PrkA  24.16 
 
 		 690 aa  63.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.795267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0032  putative serine protein kinase, PrkA  22.5 
 
 		 691 aa  62.4  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0177084 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3368  putative serine protein kinase, PrkA  22.71 
 
 		 761 aa  62  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0781677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2232  putative serine protein kinase, PrkA  22.08 
 
 		 760 aa  62  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.798823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1750  putative serine protein kinase, PrkA  24.85 
 
 		 690 aa  61.6  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2989  PrkA AAA domain protein  21.7 
 
 		 681 aa  59.3  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0507  putative serine protein kinase, PrkA  22.13 
 
 		 631 aa  58.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0168662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1550  putative serine protein kinase, PrkA  20.98 
 
 		 753 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.15082  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1749  putative serine protein kinase, PrkA  22.79 
 
 		 762 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1372  putative serine protein kinase, PrkA  23.13 
 
 		 631 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3367  putative serine protein kinase, PrkA  23.95 
 
 		 690 aa  55.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1541  serine protein kinase  23.12 
 
 		 640 aa  55.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2404  putative serine protein kinase, PrkA  20.15 
 
 		 753 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2509  PrkA serine kinase  22.12 
 
 		 643 aa  53.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00245056  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1334  serine protein kinase  22.92 
 
 		 640 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.175734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2316  putative serine protein kinase, PrkA  20.15 
 
 		 753 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0460  putative serine protein kinase, PrkA  21.66 
 
 		 632 aa  50.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2731  putative serine protein kinase, PrkA  30.07 
 
 		 644 aa  48.9  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53743  hitchhiker  0.000511226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3334  putative serine protein kinase, PrkA  21.7 
 
 		 765 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.973297  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3056  putative serine protein kinase, PrkA  25.69 
 
 		 640 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.651845  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0489  putative serine protein kinase, PrkA  22.86 
 
 		 644 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2257  putative serine protein kinase, PrkA  30.07 
 
 		 644 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1205  putative serine protein kinase, PrkA  23.74 
 
 		 642 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1073  putative serine protein kinase, PrkA  21.91 
 
 		 626 aa  45.4  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01541  hypothetical protein  28.48 
 
 		 644 aa  45.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0976  putative serine protein kinase, PrkA  28.78 
 
 		 649 aa  45.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003981  hypothetical protein  28.48 
 
 		 644 aa  45.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1859  putative serine protein kinase, PrkA  28.67 
 
 		 644 aa  44.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00683422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1849  putative serine protein kinase, PrkA  28.67 
 
 		 644 aa  44.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.159984  normal  0.0123748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01752  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  28.67 
 
 		 602 aa  44.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1232  putative Serine protein kinase, PrkA  28.48 
 
 		 639 aa  44.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1869  serine kinase family protein  28.67 
 
 		 644 aa  44.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.183837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2007  serine kinase family protein  28.67 
 
 		 644 aa  44.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2507  serine kinase family protein  28.67 
 
 		 644 aa  44.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.106478  normal  0.925793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1408  serine kinase family protein  28.67 
 
 		 644 aa  44.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0526547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1412  serine protein kinase, PrkA  28.67 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.405846  normal  0.417288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1396  serine protein kinase PrkA  28.67 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1379  serine protein kinase, PrkA  28.67 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.392186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02751  putative serine protein kinase, PrkA  28.48 
 
 		 640 aa  44.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405068  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2100  putative serine protein kinase, PrkA  28.78 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00284243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2354  hypothetical protein  28.78 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000221978  normal  0.266981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1890  serine protein kinase, PrkA  28.67 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.141906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2071  serine protein kinase, PrkA  28.67 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000277394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1991  PrkA serine protein kinase  28.78 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1671  putative serine protein kinase, PrkA  28.67 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.860121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1961  putative serine protein kinase, PrkA  29.37 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.956203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1977  putative serine protein kinase, PrkA  28.78 
 
 		 644 aa  44.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0881  putative serine protein kinase, PrkA  27.97 
 
 		 640 aa  44.3  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>