54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3344 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3344  hypothetical protein  100 
 
 		 767 aa  1598    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0240  putative serine protein kinase, PrkA  62.16 
 
 		 762 aa  1023    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.277133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0033  putative serine protein kinase, PrkA  81.52 
 
 		 754 aa  1298    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0256  putative serine protein kinase, PrkA  62.55 
 
 		 762 aa  1028    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4311  putative serine protein kinase, PrkA  74.54 
 
 		 770 aa  1221    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1721  putative serine protein kinase, PrkA  62.47 
 
 		 763 aa  1017    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2537  putative serine protein kinase, PrkA  23.72 
 
 		 690 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4656  putative serine protein kinase, PrkA  22.64 
 
 		 681 aa  97.8  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1230  putative serine protein kinase, PrkA  23.43 
 
 		 690 aa  97.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2729  putative serine protein kinase, PrkA  23.43 
 
 		 690 aa  97.4  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2635  putative serine protein kinase, PrkA  23.43 
 
 		 690 aa  97.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2210  putative serine protein kinase, PrkA  25.05 
 
 		 694 aa  94  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4175  putative serine protein kinase, PrkA  24.41 
 
 		 692 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170003  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1821  putative serine protein kinase, PrkA  24.91 
 
 		 709 aa  91.3  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0916843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1379  putative serine protein kinase, PrkA  23.73 
 
 		 692 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3529  putative serine protein kinase, PrkA  23.48 
 
 		 692 aa  87.8  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.585407  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1550  putative serine protein kinase, PrkA  20.68 
 
 		 753 aa  71.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.15082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2404  putative serine protein kinase, PrkA  20.89 
 
 		 753 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2316  putative serine protein kinase, PrkA  21.1 
 
 		 753 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0510  putative serine protein kinase, PrkA  22.74 
 
 		 630 aa  67  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1750  putative serine protein kinase, PrkA  20.72 
 
 		 690 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0412  putative serine protein kinase, PrkA  22.01 
 
 		 690 aa  66.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34499  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3367  putative serine protein kinase, PrkA  20.66 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3006  putative serine protein kinase, PrkA  22.88 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1541  serine protein kinase  23.06 
 
 		 640 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3334  putative serine protein kinase, PrkA  21.68 
 
 		 765 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.973297  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1334  serine protein kinase  22.62 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.175734  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2989  PrkA AAA domain protein  20.68 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3368  putative serine protein kinase, PrkA  23.46 
 
 		 761 aa  60.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0781677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2231  putative serine protein kinase, PrkA  22.71 
 
 		 690 aa  60.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.795267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0460  putative serine protein kinase, PrkA  22.73 
 
 		 632 aa  60.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0507  putative serine protein kinase, PrkA  22.59 
 
 		 631 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0168662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1205  putative serine protein kinase, PrkA  22.62 
 
 		 642 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1372  putative serine protein kinase, PrkA  22.67 
 
 		 631 aa  55.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1749  putative serine protein kinase, PrkA  22.39 
 
 		 762 aa  55.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2509  PrkA serine kinase  21.04 
 
 		 643 aa  55.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00245056  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2232  putative serine protein kinase, PrkA  21.35 
 
 		 760 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.798823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0489  putative serine protein kinase, PrkA  22.12 
 
 		 644 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1073  putative serine protein kinase, PrkA  22.43 
 
 		 626 aa  50.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2006  putative serine protein kinase, PrkA  22.32 
 
 		 631 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0032  putative serine protein kinase, PrkA  21.51 
 
 		 691 aa  49.3  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0177084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0465  putative serine protein kinase, PrkA  22.09 
 
 		 631 aa  48.9  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0605  hypothetical protein  22.26 
 
 		 631 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0472  putative serine protein kinase, PrkA  21.96 
 
 		 631 aa  48.5  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0461  serine protein kinase  21.96 
 
 		 631 aa  48.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0457  serine protein kinase  21.96 
 
 		 631 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0550  hypothetical protein  21.96 
 
 		 631 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.95802e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0625  hypothetical protein  21.96 
 
 		 631 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0518  hypothetical protein  21.96 
 
 		 631 aa  48.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0550  hypothetical protein  21.96 
 
 		 631 aa  48.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4752  hypothetical protein  22.09 
 
 		 631 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000158136 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0586  hypothetical protein  22.09 
 
 		 631 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2731  putative serine protein kinase, PrkA  29.05 
 
 		 644 aa  45.8  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53743  hitchhiker  0.000511226 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0591  putative serine protein kinase, PrkA  21.53 
 
 		 631 aa  44.3  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>