35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0256 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0033  putative serine protein kinase, PrkA  62.5 
 
 		 754 aa  1013    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0240  putative serine protein kinase, PrkA  98.29 
 
 		 762 aa  1558    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.277133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3344  hypothetical protein  62.55 
 
 		 767 aa  1028    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0256  putative serine protein kinase, PrkA  100 
 
 		 762 aa  1582    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1721  putative serine protein kinase, PrkA  68.2 
 
 		 763 aa  1104    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4311  putative serine protein kinase, PrkA  64.52 
 
 		 770 aa  1067    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4656  putative serine protein kinase, PrkA  26.11 
 
 		 681 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2210  putative serine protein kinase, PrkA  23.74 
 
 		 694 aa  99.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3529  putative serine protein kinase, PrkA  23.82 
 
 		 692 aa  99  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.585407  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1379  putative serine protein kinase, PrkA  23.62 
 
 		 692 aa  98.2  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2537  putative serine protein kinase, PrkA  23.34 
 
 		 690 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4175  putative serine protein kinase, PrkA  24.07 
 
 		 692 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1230  putative serine protein kinase, PrkA  23.91 
 
 		 690 aa  87.8  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2635  putative serine protein kinase, PrkA  23.72 
 
 		 690 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2729  putative serine protein kinase, PrkA  23.72 
 
 		 690 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1821  putative serine protein kinase, PrkA  23.36 
 
 		 709 aa  85.1  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0916843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1550  putative serine protein kinase, PrkA  22.43 
 
 		 753 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.15082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2404  putative serine protein kinase, PrkA  21.73 
 
 		 753 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2316  putative serine protein kinase, PrkA  21.47 
 
 		 753 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1750  putative serine protein kinase, PrkA  24.15 
 
 		 690 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2231  putative serine protein kinase, PrkA  24.2 
 
 		 690 aa  72.4  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.795267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0032  putative serine protein kinase, PrkA  22.66 
 
 		 691 aa  69.7  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0177084 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3367  putative serine protein kinase, PrkA  23.04 
 
 		 690 aa  68.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337989  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0412  putative serine protein kinase, PrkA  22.49 
 
 		 690 aa  67.4  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3006  putative serine protein kinase, PrkA  20.83 
 
 		 633 aa  60.8  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3334  putative serine protein kinase, PrkA  23.12 
 
 		 765 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.973297  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2989  PrkA AAA domain protein  21.71 
 
 		 681 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3368  putative serine protein kinase, PrkA  19.83 
 
 		 761 aa  54.7  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0781677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2232  putative serine protein kinase, PrkA  20.12 
 
 		 760 aa  51.2  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.798823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1749  putative serine protein kinase, PrkA  20.12 
 
 		 762 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0507  putative serine protein kinase, PrkA  21.9 
 
 		 631 aa  47.8  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0168662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1541  serine protein kinase  25.1 
 
 		 640 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1205  putative serine protein kinase, PrkA  23.28 
 
 		 642 aa  44.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1372  putative serine protein kinase, PrkA  22.02 
 
 		 631 aa  44.3  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1334  serine protein kinase  24.71 
 
 		 640 aa  44.3  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.175734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>