More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1143 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1143  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  100 
 
 
278 aa  559  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1023  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  61.73 
 
 
282 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0517046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3420  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  60.65 
 
 
276 aa  329  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.798896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3481  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  60.65 
 
 
276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000379099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3753  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  60 
 
 
282 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2861  hypothetical protein  59.49 
 
 
282 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189341  hitchhiker  0.000000116322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0653  tetrapyrrole methylase family protein  53.6 
 
 
286 aa  278  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0748907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2215  putative tetrapyrrole methylase family protein  54.48 
 
 
285 aa  275  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5275  tetrapyrrole methylase family protein  48.38 
 
 
291 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1987  hypothetical protein  51.43 
 
 
285 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0041  tetrapyrrole methylase family protein  47.65 
 
 
291 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1916  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  51.64 
 
 
291 aa  260  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1545  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  51.81 
 
 
284 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338638 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0035  hypothetical protein  46.93 
 
 
291 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0032  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.93 
 
 
291 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0032  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.93 
 
 
291 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0033  hypothetical protein  46.93 
 
 
291 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0041  tetrapyrrole methylase family protein  46.93 
 
 
291 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0045  tetrapyrrole methylase family protein  46.93 
 
 
291 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0034  hypothetical protein  46.93 
 
 
291 aa  254  8e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0029  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.75 
 
 
303 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0025  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  51.27 
 
 
317 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0031  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.99 
 
 
290 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0021  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.25 
 
 
289 aa  251  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0023  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.25 
 
 
289 aa  251  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0031  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.57 
 
 
291 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0104  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.33 
 
 
288 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000059008  unclonable  0.000000000241869 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03354  putative methyltransferase  49.08 
 
 
292 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0063  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.45 
 
 
286 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000661848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0046  hypothetical protein  51.28 
 
 
307 aa  246  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000617643  hitchhiker  0.00000342991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0022  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.74 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0674688 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0031  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.02 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3910  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.06 
 
 
281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20320  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.39 
 
 
286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0060  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.39 
 
 
273 aa  241  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000025326  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0366  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.25 
 
 
274 aa  241  7.999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000614532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5229  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.82 
 
 
293 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.291092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1602  hypothetical protein  45.96 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00301963  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0035  hypothetical protein  47.06 
 
 
287 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0515864  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_329  tetrapyrrole methylase  47.18 
 
 
274 aa  238  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000393533  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0386  tetrapyrrole methylase family protein  46.1 
 
 
274 aa  237  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00029302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  46.89 
 
 
287 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  49.09 
 
 
286 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0039  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.63 
 
 
282 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.350447  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  49.29 
 
 
281 aa  236  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3013  hypothetical protein  47.06 
 
 
300 aa  236  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1105  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.2 
 
 
279 aa  236  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.36 
 
 
299 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0405  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.26 
 
 
316 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  48.74 
 
 
280 aa  236  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0163  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.85 
 
 
282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000433503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  47.67 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  49.46 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2939  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.63 
 
 
323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04378  hypothetical protein  49.62 
 
 
265 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  47.29 
 
 
289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  46.55 
 
 
287 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  47.99 
 
 
281 aa  232  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2101  hypothetical protein  43.96 
 
 
280 aa  231  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000956385  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  48.19 
 
 
293 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3919  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.49 
 
 
297 aa  231  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0903297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2117  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  53.15 
 
 
276 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000303405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  48.92 
 
 
286 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1326  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.38 
 
 
294 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4522  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.38 
 
 
291 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4398  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.38 
 
 
291 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.258286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  46.04 
 
 
282 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0473  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.87 
 
 
316 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0334  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.26 
 
 
288 aa  229  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  46.15 
 
 
291 aa  229  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  48.78 
 
 
282 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  48.78 
 
 
320 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3692  hypothetical protein  46.84 
 
 
281 aa  228  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.34 
 
 
272 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.71 
 
 
273 aa  227  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3299  Fis family transcriptional regulator  48.43 
 
 
256 aa  227  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  48.04 
 
 
291 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0174  hypothetical protein  45.19 
 
 
292 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.5 
 
 
316 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0355005  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  48.34 
 
 
273 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.05 
 
 
280 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3144  putative methyltransferase  48 
 
 
280 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  52.05 
 
 
280 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0041  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.7 
 
 
285 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0934  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.67 
 
 
291 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3497  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.55 
 
 
306 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  50.2 
 
 
286 aa  225  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0282  methyltransferase  45.13 
 
 
289 aa  225  6e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.559196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.64 
 
 
280 aa  225  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.61 
 
 
286 aa  225  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  50.2 
 
 
286 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.2 
 
 
286 aa  224  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  50.2 
 
 
286 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  50.2 
 
 
287 aa  224  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0588  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.75 
 
 
238 aa  224  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.174365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  50.2 
 
 
286 aa  224  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  51.6 
 
 
280 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  46.35 
 
 
288 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  49.19 
 
 
287 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  49.19 
 
 
287 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>