More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3152 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3152  butyrate kinase  100 
 
 		 357 aa  713    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1109  butyrate kinase  93.22 
 
 		 361 aa  658    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2307  butyrate kinase  50.84 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0939  butyrate kinase  48.01 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4069  butyrate kinase  50.57 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3907  butyrate kinase  50.57 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3916  butyrate kinase  50.57 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0615579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4294  butyrate kinase  50.57 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4386  butyrate kinase  50.57 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0960  butyrate kinase  51.14 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0659702 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4184  butyrate kinase  50.57 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000389222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4236  butyrate kinase  50.57 
 
 		 367 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1069  butyrate kinase  50.42 
 
 		 375 aa  359  4e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4005  butyrate kinase  50.57 
 
 		 367 aa  359  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4274  butyrate kinase  50.57 
 
 		 367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2858  butyrate kinase  50.28 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0263  butyrate kinase  52.38 
 
 		 370 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0107  butyrate kinase  50.42 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215976  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0108  butyrate kinase  48.59 
 
 		 361 aa  349  4e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.835306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2128  butyrate kinase  48.01 
 
 		 362 aa  349  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06760  butyrate kinase  49.15 
 
 		 356 aa  342  7e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2656  butyrate kinase  48.3 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1472  butyrate kinase  49.29 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2342  butyrate kinase  48.01 
 
 		 356 aa  339  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1680  butyrate kinase  47.03 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00170652  normal  0.0185756 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2348  butyrate kinase  45.61 
 
 		 352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0590  butyrate kinase  48.31 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2844  butyrate kinase  46.02 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3544  butyrate kinase  47.18 
 
 		 362 aa  325  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.505108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2700  butyrate kinase  46.74 
 
 		 352 aa  322  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2852  butyrate kinase  49.43 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2106  butyrate kinase  47.29 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0936  butyrate kinase  43.5 
 
 		 353 aa  299  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0109  butyrate kinase  42.94 
 
 		 356 aa  298  7e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01633  butyrate kinase  42.98 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2358  butyrate kinase  46.25 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0714814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0106  butyrate kinase  41.69 
 
 		 357 aa  295  8e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21870  butyrate kinase  41.97 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3128  butyrate kinase  44.02 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1041  butyrate kinase  42.05 
 
 		 357 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.496289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1071  butyrate kinase  42.33 
 
 		 357 aa  278  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2626  butyrate kinase  39.31 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0591  butyrate kinase  41.39 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1366  butyrate kinase  41.81 
 
 		 370 aa  272  6e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2330  butyrate kinase  44.57 
 
 		 372 aa  271  9e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1470  butyrate kinase  38.55 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0042  butyrate kinase  44.38 
 
 		 368 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0058  butyrate kinase  44.38 
 
 		 376 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.870551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0045  butyrate kinase  44.23 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.90675 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0046  butyrate kinase  44.38 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0454  butyrate kinase  38.08 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1383  butyrate kinase  37.28 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000142085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0258  Butyrate kinase  33.45 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  31.16 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  27.95 
 
 		 411 aa  97.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  32.6 
 
 		 380 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  25.94 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  31.76 
 
 		 583 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  29.54 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  27.73 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  31.64 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  33.73 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  31.36 
 
 		 403 aa  89.4  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  31.36 
 
 		 403 aa  89.4  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  27.19 
 
 		 396 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  32.93 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  31.36 
 
 		 772 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  25 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  33.93 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  26.59 
 
 		 396 aa  87  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  26.07 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  28.8 
 
 		 398 aa  86.3  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  28.8 
 
 		 398 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  32.12 
 
 		 394 aa  85.9  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  26.65 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  32.39 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  25.36 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  29.94 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  26.91 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  33.52 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  25.41 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  31.88 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  31.58 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  24.93 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  24.93 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  24.93 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  28.57 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  27.6 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  30.84 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  25.21 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  31.38 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  25.21 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  27.09 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  29.87 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  28.16 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  25.21 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  24.93 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  24.93 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  32.42 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4073  acetate kinase  29.62 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>