More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_R0086 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_R0086  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0079  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0065  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00709117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0076  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0036  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.290713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  95.89 
 
 		 78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  95.89 
 
 		 78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  95.89 
 
 		 78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0110  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0045  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  96.83 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  96.83 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000810946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791725  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 155 bp  95.6  1e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0029  tRNA-Thr  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  96.23 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2874  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.51003e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0091  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000624593  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0084  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000225446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0024  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0011  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000845493  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0064  tRNA-Thr  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3670  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2972  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3645  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0049  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0016  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.669511  normal  0.713856 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0016  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00244932  hitchhiker  0.00000298756 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R11  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0015  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3702  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0016  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000863002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>