More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Thr-1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0076  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0079  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0065  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00709117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0086  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0036  tRNA-Thr  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.290713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 78 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 79 bp  99.6  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 79 bp  99.6  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 79 bp  99.6  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 79 bp  99.6  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 79 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 79 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 73 bp  99.6  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 78 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 73 bp  99.6  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  95.16 
 
 		 78 bp  99.6  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2874  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.51003e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0084  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000225446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0091  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000624593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0011  tRNA-Thr  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000845493  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000810946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791725  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  96 
 
 		 155 bp  83.8  0.000000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0088  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0412207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0019  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00333528  normal  0.979216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0094  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00138001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0013  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000751402  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0011  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0010  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000391547  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0127  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000904299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0033  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000977619  normal  0.440974 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0004  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000250718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0103  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000642659  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0092  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000157949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0042  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000882152  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0050  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0052  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000085939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0012  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000866174  hitchhiker  0.00954127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0051  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0041266  normal  0.480692 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0053  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0009  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0113  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0423055  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1446  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00029205  normal  0.742429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0101  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000191032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0110  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000430973  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0112  tRNA-Thr  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000415626  normal  0.792835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>