68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2994 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  100 
 
 		 430 aa  894    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3450  hypothetical protein  54.21 
 
 		 254 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2249  hypothetical protein  54.21 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3455  hypothetical protein  55.77 
 
 		 252 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3819  hypothetical protein  55.77 
 
 		 252 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3535  hypothetical protein  55.77 
 
 		 252 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942352  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01536  conserved hypothetical protein  50.5 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0921413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01527  hypothetical protein  50.5 
 
 		 321 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0517031  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1775  phage O family protein  50.5 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2616  hypothetical protein  47.06 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00545088 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2245  hypothetical protein  37.69 
 
 		 347 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000488792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0794  replication initiation and membrane attachment family protein  61.8 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2061  hypothetical protein  48.24 
 
 		 304 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0561  DnaA analog, DnaD domain protein  44.09 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0622726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  44.21 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  41.18 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1357  DnaD domain protein  47.5 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3612  primosome, DnaD subunit  43.02 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0089  hypothetical protein  29.52 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0984829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1109  DnaD domain protein  45.21 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0256887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2597  phage replication protein  30.65 
 
 		 248 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1027  DnaD domain-containing protein  44 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0933  DnaD domain-containing protein  45.21 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0848  phage replication protein  46.58 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0879  DnaD domain-containing protein  45.21 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1023  DnaD domain protein  45.21 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.81342e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0839  phage replication protein  45.21 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0831  primosome, DnaD subunit  45.21 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0982  DnaD domain protein  43.84 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4331  DnaD domain protein  43.84 
 
 		 288 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0351037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  30.15 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0424  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  36.71 
 
 		 290 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0438  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  36.71 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000555393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3828  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  36.71 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4121  prophage LambdaBa02, DNA replication protein  36.71 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2664  replication initiation and membrane attachment family protein  46.48 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.245014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4024  putative prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  34.18 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1507  phage replication protein  33.62 
 
 		 295 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0584377 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0332  primosome, DnaD subunit  28.06 
 
 		 297 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2038  primosome, DnaD subunit  28.06 
 
 		 297 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0323  primosome, DnaD subunit  28.06 
 
 		 297 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2075  primosome, DnaD subunit  28.06 
 
 		 297 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.760964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2725  primosome, DnaD subunit  28.57 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00361289  hitchhiker  0.000707031 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3267  DnaD domain protein  42.86 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2981  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3088  DnaD domain-containing protein  37.31 
 
 		 246 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3331  DnaD domain-containing protein  37.31 
 
 		 246 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  40.3 
 
 		 258 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0559  hypothetical protein  27.68 
 
 		 286 aa  50.4  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1980  phage protein  43.33 
 
 		 258 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3032  hypothetical protein  37.88 
 
 		 243 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3294  DnaD domain-containing protein  27.56 
 
 		 250 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  55.32 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4410  replication initiation and membrane attachment family protein  39.6 
 
 		 468 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000811972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  22.04 
 
 		 409 aa  47  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0549  replication initiation and membrane attachment protein  37.62 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000137363  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3302  DnaD domain protein  25.62 
 
 		 250 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4475  DNA replication protein DnaB  38 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4689  DNA replication protein DnaB  37.62 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000113509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4704  replication initiation and membrane attachment protein  38 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000244934  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3310  DnaD domain protein  38.33 
 
 		 247 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4694  DNA replication protein DnaB  38 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.07673e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4310  DNA replication protein DnaB  38 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00029948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4321  DNA replication protein  38 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.288406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2999  primosome, DnaD subunit  35.9 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000267643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4823  DNA replication protein DnaB  38 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000137358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4710  DNA replication protein DnaB  38 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  30.65 
 
 		 272 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>