18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0332 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2075  primosome, DnaD subunit  100 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.760964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0332  primosome, DnaD subunit  100 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2038  primosome, DnaD subunit  100 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0323  primosome, DnaD subunit  100 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0940  hypothetical protein  39.62 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  28.06 
 
 
430 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0817  hypothetical protein  27.5 
 
 
267 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.205179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1507  phage replication protein  25.16 
 
 
295 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0584377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0040  DnaD and phage-associated region  27.78 
 
 
240 aa  46.6  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  29.91 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0438  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  30.77 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000555393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0424  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  30.77 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2597  phage replication protein  31.17 
 
 
248 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1126  hypothetical protein  25.4 
 
 
197 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4024  putative prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  28.75 
 
 
290 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2725  primosome, DnaD subunit  27.87 
 
 
354 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00361289  hitchhiker  0.000707031 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1027  DnaD domain-containing protein  27 
 
 
286 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  29.41 
 
 
313 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>