76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1859 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  100 
 
 
300 aa  610  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  64.91 
 
 
300 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3766  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  52.2 
 
 
301 aa  324  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3987  hypothetical protein  51.86 
 
 
301 aa  322  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2642  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  51.75 
 
 
301 aa  322  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4058  hypothetical protein  51.53 
 
 
301 aa  321  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4042  hypothetical protein  51.19 
 
 
301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1197  hypothetical protein  50.85 
 
 
319 aa  318  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4150  hypothetical protein  50.51 
 
 
301 aa  315  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3852  hypothetical protein  50.51 
 
 
301 aa  315  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3700  CtaG membrane protein  50.51 
 
 
301 aa  315  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3683  hypothetical protein  50.51 
 
 
301 aa  315  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3955  hypothetical protein  50.51 
 
 
301 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  27.07 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  28.26 
 
 
265 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  25.27 
 
 
273 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  27.44 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  24.81 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.2 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.12 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  27.35 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  23.08 
 
 
651 aa  66.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  26.59 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  25.94 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.19 
 
 
654 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  25.54 
 
 
332 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  25.08 
 
 
665 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  25.08 
 
 
665 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  25.08 
 
 
665 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  22.22 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  25.2 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.34 
 
 
290 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  23.39 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2479  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.32 
 
 
208 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  24.26 
 
 
722 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  22.51 
 
 
675 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  22.18 
 
 
661 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.22 
 
 
319 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  25.83 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  23.6 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  27.62 
 
 
692 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  28.31 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  20 
 
 
271 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0577  hypothetical protein  22.71 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0301606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.32 
 
 
731 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  25.43 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  24.03 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  25.43 
 
 
266 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  25.43 
 
 
290 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  25.43 
 
 
290 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  25.43 
 
 
290 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  25.43 
 
 
290 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  25.43 
 
 
290 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  25.43 
 
 
290 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  23.04 
 
 
296 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  28 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  30.94 
 
 
679 aa  45.8  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  24.41 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  20.95 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  25.62 
 
 
671 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  21.85 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  32.48 
 
 
651 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  25.9 
 
 
254 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  22.77 
 
 
672 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  23.44 
 
 
613 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  23.95 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  23.64 
 
 
676 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  22.13 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  21.31 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  28.51 
 
 
711 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  26.5 
 
 
273 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  25.91 
 
 
681 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  27.2 
 
 
277 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  22.69 
 
 
686 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  27.2 
 
 
277 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  27.2 
 
 
277 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>