37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0577 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0577  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  565  1e-160  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0301606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3766  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  23.79 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2642  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  24.62 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4058  hypothetical protein  25.67 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3852  hypothetical protein  23.02 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3683  hypothetical protein  23.02 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3700  CtaG membrane protein  23.02 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4150  hypothetical protein  23.02 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  23.68 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3955  hypothetical protein  23.02 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4042  hypothetical protein  25.13 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1197  hypothetical protein  25.13 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  22.71 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3987  hypothetical protein  24.6 
 
 
301 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  23.74 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  27 
 
 
264 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  23.01 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  28.64 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  23.37 
 
 
661 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  29.29 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  25.26 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  26.24 
 
 
722 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  28.04 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  28.04 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  28.04 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  24.6 
 
 
671 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.03 
 
 
683 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  27.78 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  27.69 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  27.78 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  27.78 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  27.78 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  27.78 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  27.78 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  27.78 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  23.2 
 
 
711 aa  42.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  27.78 
 
 
266 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>