24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0196 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
386 aa  795    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  68.56 
 
 
388 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  41.92 
 
 
423 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.72 
 
 
379 aa  143  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.89 
 
 
406 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.3 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.58 
 
 
1034 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.11 
 
 
1034 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.79 
 
 
1074 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  26.2 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.21 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.21 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.21 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.11 
 
 
500 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  27.37 
 
 
351 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.58 
 
 
440 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.59 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.63 
 
 
432 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.7 
 
 
453 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  25.64 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.59 
 
 
446 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  22.63 
 
 
698 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  23.89 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.46 
 
 
424 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>