17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0151 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 203 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  63.55 
 
 		 203 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000067167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  29.46 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  30.65 
 
 		 363 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  37.68 
 
 		 360 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0804  hypothetical protein  29.63 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0781  putative transmembrane anti-sigma factor  32 
 
 		 80 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40.85 
 
 		 376 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4156  putative transmembrane anti-sigma factor  33.75 
 
 		 366 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0909715  hitchhiker  0.000583924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0114  hypothetical protein  38.71 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0503124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0100  putative transmembrane anti-sigma factor  28.57 
 
 		 371 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.314506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1893  putative transmembrane anti-sigma factor  30.16 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  28.05 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3851  putative anti-sigma factor  25.32 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  26.73 
 
 		 146 aa  42.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  31.03 
 
 		 91 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0899  putative transmembrane anti-sigma factor  30.59 
 
 		 258 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>