More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1235 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  74.6 
 
 
446 aa  715    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  85.36 
 
 
444 aa  811    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  67.64 
 
 
448 aa  635    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  76.42 
 
 
446 aa  725    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  85.81 
 
 
444 aa  813    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  85.81 
 
 
444 aa  813    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  85.81 
 
 
444 aa  813    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  85.81 
 
 
444 aa  813    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  84.68 
 
 
444 aa  808    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  85.81 
 
 
444 aa  813    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  100 
 
 
444 aa  924    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  67.87 
 
 
445 aa  664    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  85.59 
 
 
444 aa  812    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  94.37 
 
 
444 aa  881    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  76.42 
 
 
446 aa  725    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  86.71 
 
 
444 aa  819    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  84.91 
 
 
444 aa  809    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  84.68 
 
 
444 aa  808    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  68.85 
 
 
446 aa  621  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  66.44 
 
 
447 aa  624  1e-177  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  65.02 
 
 
445 aa  616  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  63.8 
 
 
447 aa  614  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  65.6 
 
 
444 aa  608  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  65.45 
 
 
442 aa  608  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  66.51 
 
 
444 aa  610  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  64.33 
 
 
448 aa  610  1e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  63.95 
 
 
443 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  63.57 
 
 
443 aa  599  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  63.1 
 
 
441 aa  597  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  62.7 
 
 
444 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  63.29 
 
 
445 aa  588  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  62.81 
 
 
444 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  60.63 
 
 
447 aa  585  1e-166  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  62.47 
 
 
449 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  61.9 
 
 
443 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  60.77 
 
 
443 aa  578  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  62.3 
 
 
446 aa  577  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  60.96 
 
 
442 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  61.15 
 
 
440 aa  568  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  62.19 
 
 
444 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  58.78 
 
 
443 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  57.21 
 
 
442 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  57.44 
 
 
442 aa  530  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  58.09 
 
 
439 aa  530  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  58.5 
 
 
452 aa  531  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  54.79 
 
 
448 aa  528  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  57.11 
 
 
442 aa  529  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  56.17 
 
 
453 aa  525  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  59.02 
 
 
439 aa  525  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  60.19 
 
 
442 aa  522  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  55.35 
 
 
447 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  57.18 
 
 
456 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  56.19 
 
 
461 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  58.85 
 
 
452 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  54.42 
 
 
442 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  52.91 
 
 
445 aa  510  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  56.24 
 
 
441 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  56.46 
 
 
443 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  55.96 
 
 
439 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  55.96 
 
 
441 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  56.09 
 
 
433 aa  495  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  57.27 
 
 
451 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  53.21 
 
 
439 aa  494  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  56.14 
 
 
456 aa  488  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  57.24 
 
 
451 aa  491  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  57.21 
 
 
451 aa  486  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  56.92 
 
 
449 aa  486  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  52.93 
 
 
446 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  52.7 
 
 
446 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  52.53 
 
 
448 aa  482  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  57.18 
 
 
450 aa  484  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  52.48 
 
 
446 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  52.05 
 
 
443 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  51.58 
 
 
446 aa  475  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  54.09 
 
 
437 aa  478  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  51.6 
 
 
443 aa  477  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  53.38 
 
 
450 aa  477  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  51.55 
 
 
443 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  51.36 
 
 
443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  50.79 
 
 
444 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  51.82 
 
 
446 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  50.88 
 
 
457 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  53.69 
 
 
444 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  50.45 
 
 
446 aa  458  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  50.91 
 
 
448 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  51.37 
 
 
447 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  50.91 
 
 
447 aa  448  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  48.07 
 
 
443 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  50 
 
 
449 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  49.1 
 
 
443 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  49.32 
 
 
450 aa  433  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  48.43 
 
 
444 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  48.42 
 
 
444 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  46.8 
 
 
448 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  48.44 
 
 
444 aa  415  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  46.01 
 
 
445 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  47.39 
 
 
440 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  45.64 
 
 
453 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  45.98 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  45.98 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>