21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2965 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  359  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  39.58 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  37.06 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  35.21 
 
 		 146 aa  85.5  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  36.69 
 
 		 146 aa  84.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  36.69 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  31.47 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  35.86 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  31.54 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  33.08 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  35.16 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  33.11 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  30 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  29.5 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  25.87 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  26.56 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  25.78 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  30.69 
 
 		 121 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  30.69 
 
 		 121 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  30.77 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  36.26 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>