297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2143 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  83.2 
 
 		 489 aa  862    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  79 
 
 		 489 aa  821    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  77.96 
 
 		 489 aa  806    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  70.84 
 
 		 487 aa  738    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  80.5 
 
 		 489 aa  845    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  100 
 
 		 487 aa  1016    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  90.55 
 
 		 487 aa  939    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  98.56 
 
 		 487 aa  1006    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  81.93 
 
 		 487 aa  850    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  79.83 
 
 		 489 aa  829    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  54.7 
 
 		 512 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  56.4 
 
 		 511 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  56.4 
 
 		 512 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  55.87 
 
 		 511 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.04 
 
 		 511 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.67 
 
 		 519 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.78 
 
 		 472 aa  522  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.96 
 
 		 519 aa  520  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.26 
 
 		 519 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  52.9 
 
 		 519 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1075  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.32 
 
 		 537 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.902597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.28 
 
 		 519 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.73 
 
 		 519 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.4 
 
 		 519 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.46 
 
 		 511 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  50.4 
 
 		 519 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.46 
 
 		 511 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.14 
 
 		 520 aa  511  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.92 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.94 
 
 		 512 aa  501  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.4 
 
 		 510 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.56 
 
 		 523 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.52 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.58 
 
 		 518 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.58 
 
 		 518 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1467  nitrogenase, molybdenum-iron protein beta chain(NifK)  50.43 
 
 		 519 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  hitchhiker  0.00055229 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.53 
 
 		 519 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.41 
 
 		 518 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1432  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.39 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  46.88 
 
 		 523 aa  489  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.16 
 
 		 522 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47.79 
 
 		 519 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.48 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.64 
 
 		 524 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47.86 
 
 		 506 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47.86 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.72 
 
 		 519 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47.23 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47.44 
 
 		 506 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.86 
 
 		 510 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47.49 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.02 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  39.47 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.36 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.19 
 
 		 459 aa  342  8e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.23 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39 
 
 		 461 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.7 
 
 		 463 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  37.61 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.15 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.69 
 
 		 485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.77 
 
 		 459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.55 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.74 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.2 
 
 		 460 aa  323  4e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.72 
 
 		 460 aa  323  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.32 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.36 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.24 
 
 		 458 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  38.85 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  38.85 
 
 		 462 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  38.63 
 
 		 462 aa  297  4e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  34.45 
 
 		 477 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  34.95 
 
 		 458 aa  294  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  36.69 
 
 		 490 aa  292  9e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  37.39 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  36.38 
 
 		 475 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  36.43 
 
 		 475 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  34.87 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  35.09 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  35.01 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  36.59 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  34.97 
 
 		 462 aa  261  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  35.49 
 
 		 472 aa  259  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02590  vanadium nitrogenase beta subunit, vnfK  35.39 
 
 		 475 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  35.57 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  34.63 
 
 		 456 aa  251  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  34.75 
 
 		 462 aa  250  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  33.41 
 
 		 457 aa  249  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  33.86 
 
 		 450 aa  249  6e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  33.11 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  33.78 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  34.14 
 
 		 538 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  32.22 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  34.23 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  33.33 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4681  nitrogenase  32.43 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  34.01 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  33.33 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  34.7 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>