31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0093 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  89.73 
 
 		 146 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  34.68 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  35.53 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  37.42 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  33.73 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  36.13 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  34.27 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  35.67 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  30.57 
 
 		 215 aa  85.1  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  30.29 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  34.42 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  30.06 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  31.07 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  30.46 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  32.45 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  27.97 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  25.88 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  30.57 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  27.42 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  25.71 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5029  putative transmembrane protein  28.68 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313273  normal  0.903322 
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  34.27 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  22.22 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  25.81 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4669  hypothetical protein  23.4 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865446 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  28.47 
 
 		 235 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3632  hypothetical protein  21.48 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>