31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0093 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  380  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64586e-08 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  89.73 
 
 
146 aa  271  5e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  34.68 
 
 
182 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  35.53 
 
 
184 aa  112  4e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  37.42 
 
 
178 aa  101  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  33.73 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  36.13 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54813e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  34.27 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  35.67 
 
 
200 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  30.57 
 
 
215 aa  85.1  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  30.29 
 
 
217 aa  81.3  9e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  34.42 
 
 
177 aa  80.5  1e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  30.06 
 
 
179 aa  74.7  7e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  38.46 
 
 
190 aa  73.9  1e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  31.07 
 
 
183 aa  74.3  1e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  38.46 
 
 
190 aa  73.9  1e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  30.46 
 
 
178 aa  72  5e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  32.45 
 
 
185 aa  69.3  3e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  27.97 
 
 
199 aa  68.2  6e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  25.88 
 
 
167 aa  68.2  7e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  30.57 
 
 
170 aa  64.3  1e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  27.42 
 
 
186 aa  59.3  3e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  25.71 
 
 
179 aa  56.6  2e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5029  putative transmembrane protein  28.68 
 
 
176 aa  54.7  8e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313273  normal  0.903322 
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  34.27 
 
 
188 aa  54.3  9e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  22.22 
 
 
176 aa  49.3  3e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  25.81 
 
 
171 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4669  hypothetical protein  23.4 
 
 
188 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0865446 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  28.47 
 
 
235 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3632  hypothetical protein  21.48 
 
 
177 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>