289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6248 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6248  putative phosphate binding ABC transporter  100 
 
 
510 aa  1036    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0983725  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.73 
 
 
291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  32.05 
 
 
296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  31.88 
 
 
298 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  32.01 
 
 
292 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  31.5 
 
 
308 aa  123  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.5 
 
 
308 aa  123  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.5 
 
 
308 aa  123  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  31.5 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.5 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  31.5 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.5 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.94 
 
 
288 aa  122  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  31.25 
 
 
304 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  30.24 
 
 
290 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.25 
 
 
300 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  30 
 
 
306 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.2 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.51 
 
 
300 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.15 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  29.08 
 
 
285 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.37 
 
 
286 aa  111  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  28.14 
 
 
284 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.43 
 
 
272 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  31.2 
 
 
303 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  28.93 
 
 
271 aa  107  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  29.56 
 
 
303 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.81 
 
 
300 aa  105  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  30.6 
 
 
332 aa  103  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  29.66 
 
 
278 aa  103  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  26.95 
 
 
290 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  30.7 
 
 
285 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  30.07 
 
 
294 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  30.26 
 
 
281 aa  100  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  27.49 
 
 
272 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1882  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.59 
 
 
298 aa  97.8  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.628761  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  29.52 
 
 
283 aa  97.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1881  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.67 
 
 
283 aa  97.4  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.67 
 
 
299 aa  97.1  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  28.57 
 
 
277 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  26.32 
 
 
284 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 
273 aa  95.1  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  27.01 
 
 
290 aa  94.4  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.54 
 
 
285 aa  94.4  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  29.56 
 
 
270 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  28.29 
 
 
273 aa  93.2  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28.39 
 
 
218 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  27.44 
 
 
271 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  25.09 
 
 
274 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  32.58 
 
 
272 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  26.71 
 
 
273 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  31.94 
 
 
274 aa  91.7  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  26.64 
 
 
272 aa  91.7  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  31.02 
 
 
309 aa  91.3  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  32.71 
 
 
272 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  27.14 
 
 
274 aa  91.3  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
268 aa  90.9  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  26.4 
 
 
276 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  26.55 
 
 
272 aa  90.1  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  26.97 
 
 
286 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  32.21 
 
 
272 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  29.96 
 
 
280 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.72 
 
 
276 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.23 
 
 
293 aa  89  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  25.97 
 
 
272 aa  88.6  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  28.04 
 
 
270 aa  87.8  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  27.99 
 
 
279 aa  87.8  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  23.25 
 
 
274 aa  87  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  26.74 
 
 
273 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  26.95 
 
 
381 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.91 
 
 
277 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  27.88 
 
 
272 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1794  phosphate-binding protein PstS-like protein  30.55 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  27.24 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1402  hypothetical protein  32.72 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.728708 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  28.41 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  32.49 
 
 
330 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  31.05 
 
 
301 aa  84  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.69 
 
 
278 aa  84  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  24.34 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  28.33 
 
 
277 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  26.74 
 
 
264 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  25.93 
 
 
268 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  24.92 
 
 
278 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  25.19 
 
 
267 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  27.59 
 
 
279 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  27.72 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  27.27 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  29.1 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  26.87 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  28.78 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  28.09 
 
 
292 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  25.26 
 
 
269 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  27.27 
 
 
272 aa  79  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  32.57 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  27.72 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  25.09 
 
 
273 aa  77  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  25.52 
 
 
288 aa  77  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0005  extracellular solute-binding protein, family 1  25.25 
 
 
291 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  23.36 
 
 
273 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>