132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1545 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1545  putative methyltransferase  100 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2218  hypothetical protein  54.49 
 
 		 351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  32.14 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  30.36 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1717  methyltransferase  30.88 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.203121  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0827  putative methyltransferase  26.87 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  38.04 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  37.33 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  35.29 
 
 		 276 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 604 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 604 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 604 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 604 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1707  hypothetical protein  25.5 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.410667  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 659 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  33.88 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  24.82 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  36.11 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  33.47 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  33.47 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  32.5 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 648 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  35.37 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  33.18 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  32 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  34.38 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  34.38 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  32 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3004  hypothetical protein  26.34 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108605  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 639 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  31.96 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  32.05 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3250  hypothetical protein  23.13 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0933  putative methyltransferase  34.08 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  31.65 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1346  putative methyltransferase  33.84 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3264  hypothetical protein  26.09 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3019  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  29.89 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  26.92 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  32.87 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3252  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000435878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2941  hypothetical protein  25.27 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.324225  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  26.11 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  29.43 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  34.63 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2007  hypothetical protein  25.12 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000735866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  33.19 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  34.63 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  34.63 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2390  putative methyltransferase  37.88 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206641  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  37.25 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3270  methyltransferase, putative, family  24.73 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.716508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  37.42 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  36.9 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  37.25 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  37.25 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  35.79 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10739  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.195713  normal  0.904261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  35.83 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10146  hypothetical protein  39.29 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  37.85 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  36.9 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  34.83 
 
 		 798 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  30.56 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0188  putative methyltransferase  34.69 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  35.71 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  36.72 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  37.6 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  26.86 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  29.56 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10912  hypothetical protein  30.28 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  32.39 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  33.76 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  33.33 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1131  methyltransferase  25.95 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  38.31 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  33.76 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  33.76 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  33.76 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  33.76 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  33.76 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  25.25 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12764  hypothetical protein  35.61 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.454721 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  35.16 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  31.43 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3182  methyltransferase  31.28 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  38.52 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  38.52 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  38.52 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7735  protein of unknown function Mtu_121  32.49 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  31.62 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  29.23 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  32.31 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0168  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.627272 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>