More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4322 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4322  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
316 aa  617  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0286  quinone oxidoreductase putative PIG3  74.52 
 
 
316 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  61.46 
 
 
328 aa  368  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  62.22 
 
 
329 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  58.47 
 
 
324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  58.6 
 
 
333 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  59.62 
 
 
320 aa  338  9e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  57.38 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.37 
 
 
324 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  60.44 
 
 
324 aa  332  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  55.97 
 
 
343 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13811  oxidoreductase  55.21 
 
 
328 aa  316  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.334281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  57.91 
 
 
325 aa  310  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  58.75 
 
 
329 aa  310  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  54.6 
 
 
326 aa  311  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.35 
 
 
327 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  55.35 
 
 
327 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  55.35 
 
 
327 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  55.35 
 
 
324 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5615  alcohol dehydrogenase  55.21 
 
 
325 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  56.51 
 
 
353 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  54.52 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  57.96 
 
 
325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  54.07 
 
 
327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  54.07 
 
 
327 aa  301  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  56.09 
 
 
318 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  50.99 
 
 
324 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4094  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  54.58 
 
 
325 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.52 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  46.56 
 
 
325 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.52 
 
 
336 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  48.2 
 
 
336 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  45.75 
 
 
389 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.88 
 
 
331 aa  258  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  43.28 
 
 
332 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.23 
 
 
335 aa  255  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.87 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0397  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.15 
 
 
327 aa  252  6e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  45.25 
 
 
335 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.21 
 
 
326 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.25 
 
 
334 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.25 
 
 
326 aa  250  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.1 
 
 
328 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.38 
 
 
328 aa  249  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.41 
 
 
342 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  45.6 
 
 
328 aa  248  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.44 
 
 
338 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.77 
 
 
332 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  47.21 
 
 
328 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.76 
 
 
338 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  46.56 
 
 
333 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  47.54 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.26 
 
 
335 aa  245  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.59 
 
 
334 aa  245  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.42 
 
 
332 aa  245  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  45.28 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  42.21 
 
 
338 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
332 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.22 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.67 
 
 
332 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.19 
 
 
333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.81 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03640  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.4 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.325651  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0568  quinone oxidoreductase putative PIG3  45.18 
 
 
333 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  44.59 
 
 
341 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
332 aa  238  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0270  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  43.95 
 
 
320 aa  238  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.974154  normal  0.251208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  43.61 
 
 
335 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2964  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.57 
 
 
337 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 
332 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 
333 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.81 
 
 
334 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  44.52 
 
 
334 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1025  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.05 
 
 
339 aa  235  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0042079  normal  0.442339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3311  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  40.97 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.99 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  42.68 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  42.22 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  41.97 
 
 
332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  41.97 
 
 
332 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.44 
 
 
326 aa  232  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0832  alcohol dehydrogenase  42.16 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000430219  normal  0.313635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.02 
 
 
332 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1126  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.37 
 
 
339 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1833  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.37 
 
 
339 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.37 
 
 
339 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.413421  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1286  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.37 
 
 
339 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0409  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.37 
 
 
339 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  44.84 
 
 
334 aa  231  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.37 
 
 
360 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.48 
 
 
334 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  41.78 
 
 
336 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  41.78 
 
 
336 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.77 
 
 
338 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1057  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  44.76 
 
 
339 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0935  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  40.97 
 
 
329 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000152642 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  44.09 
 
 
339 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  44.09 
 
 
339 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  43.17 
 
 
338 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  41.78 
 
 
336 aa  229  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>