More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1458 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1458  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 487 aa  941    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961762  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5057  GTP-binding protein EngA  88.81 
 
 		 462 aa  748    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2981  ribosome-associated GTPase EngA  70 
 
 		 447 aa  611  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1616  GTP-binding protein EngA  68.64 
 
 		 471 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1924  ribosome-associated GTPase EngA  65.89 
 
 		 515 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00693706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2826  small GTP-binding protein  70.27 
 
 		 463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000744132  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  68.19 
 
 		 463 aa  597  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  65.93 
 
 		 531 aa  596  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1497  small GTP-binding protein  66.29 
 
 		 476 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4051  small GTP-binding protein  66.74 
 
 		 483 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567196  normal  0.594075 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  67.13 
 
 		 490 aa  588  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2369  ribosome-associated GTPase EngA  69.04 
 
 		 482 aa  591  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.931884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  65.92 
 
 		 516 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  65.25 
 
 		 725 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  66.14 
 
 		 478 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  67.13 
 
 		 755 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14830  GTP-binding protein EngA  69.57 
 
 		 470 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4423  small GTP-binding protein  68.35 
 
 		 465 aa  578  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2815  ribosome-associated GTPase EngA  67.1 
 
 		 478 aa  578  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.560303  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  64.62 
 
 		 516 aa  579  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3274  GTP-binding protein EngA  68.36 
 
 		 470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3059  small GTP-binding protein  65.46 
 
 		 493 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296218  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3493  GTP-binding protein EngA  68.06 
 
 		 479 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1921  GTP-binding protein EngA  67.8 
 
 		 467 aa  571  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39722  hitchhiker  0.00139595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3000  GTP-binding protein  63.7 
 
 		 472 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11728  GTP-binding protein EngA  68.6 
 
 		 463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000105319  normal  0.501933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  67.43 
 
 		 495 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2942  GTP-binding protein EngA  70.18 
 
 		 471 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2927  GTP-binding protein EngA  70.18 
 
 		 471 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15170  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  65.28 
 
 		 527 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00982196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2971  GTP-binding protein EngA  70.18 
 
 		 471 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1930  GTP-binding protein EngA  68.31 
 
 		 467 aa  558  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322711  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2503  GTP-binding protein EngA  63.62 
 
 		 461 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3115  GTP-binding protein EngA  65.48 
 
 		 496 aa  544  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241248 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14040  GTP-binding protein EngA  66.82 
 
 		 512 aa  539  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.732945  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  59.5 
 
 		 709 aa  526  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1233  small GTP-binding protein  65.73 
 
 		 458 aa  528  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.765411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  56.56 
 
 		 734 aa  523  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  43.58 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  44.67 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  46.01 
 
 		 444 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  43.35 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  42.2 
 
 		 436 aa  362  9e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  43.12 
 
 		 436 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  43.12 
 
 		 436 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  43.12 
 
 		 436 aa  362  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  43.12 
 
 		 436 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  43.12 
 
 		 436 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  43.12 
 
 		 436 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  43.12 
 
 		 436 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  43.12 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.24 
 
 		 438 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  41.74 
 
 		 436 aa  360  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  43.05 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  42.92 
 
 		 436 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  41.82 
 
 		 440 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  42.3 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  41.8 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  40.87 
 
 		 438 aa  352  8e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  41.14 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  42.6 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  41.51 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  41.9 
 
 		 440 aa  350  5e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  44.19 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  41.94 
 
 		 441 aa  349  8e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  41.8 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 439 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  40.87 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  42.63 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  42.73 
 
 		 440 aa  347  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  43.08 
 
 		 440 aa  346  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  44.34 
 
 		 438 aa  346  6e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  38.72 
 
 		 438 aa  345  7e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  38.72 
 
 		 438 aa  345  7e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  39.5 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  40.27 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  40.27 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  41.06 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  44.1 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  40.55 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  44.57 
 
 		 493 aa  343  5e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  40.27 
 
 		 433 aa  342  7e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  41.94 
 
 		 442 aa  342  1e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  43.71 
 
 		 494 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  41.47 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  42.6 
 
 		 449 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  42.63 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  40.27 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  43.52 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  42.07 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  41 
 
 		 439 aa  331  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  42.15 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  41.86 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  42.76 
 
 		 438 aa  330  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  38.71 
 
 		 440 aa  329  6e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 455 aa  329  8e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  43.62 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  40.96 
 
 		 438 aa  326  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  41.04 
 
 		 456 aa  326  7e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  39.64 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>