19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0538 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1733  hypothetical protein  42.32 
 
 		 836 aa  639    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0538  hypothetical protein  100 
 
 		 885 aa  1786    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000796497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1792  hypothetical protein  42.6 
 
 		 836 aa  665    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.201909  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0894  hypothetical protein  30.41 
 
 		 821 aa  253  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0819646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  25.51 
 
 		 918 aa  67  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1988  hypothetical protein  25.35 
 
 		 923 aa  65.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.36521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  28.44 
 
 		 901 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  28.96 
 
 		 1206 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  24.64 
 
 		 956 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  26.01 
 
 		 977 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.18 
 
 		 1021 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0028  hypothetical protein  24.75 
 
 		 914 aa  50.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  27.07 
 
 		 881 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  25 
 
 		 1077 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  23.61 
 
 		 1078 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2294  hypothetical protein  26.12 
 
 		 326 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1234  trep  23.36 
 
 		 924 aa  47.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  23.05 
 
 		 970 aa  44.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  22.39 
 
 		 976 aa  44.3  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>