84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1056 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1056  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  100 
 
 
65 aa  117  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  70.59 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  72.55 
 
 
70 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  64.29 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  58.49 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  57.14 
 
 
75 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  62.75 
 
 
73 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  58.18 
 
 
76 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  58.18 
 
 
76 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  58.18 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  62.75 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3215  ATP synthase F0, C subunit  78.57 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.112485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  60.78 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  55.36 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  60.78 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  61.22 
 
 
75 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  61.22 
 
 
75 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  60.87 
 
 
73 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2097  ATP synthase F0, C subunit  62.22 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.887502  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0180  ATP synthase, subunit C (H(+)-transporting two-sector ATPase)  63.16 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.51432  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
68 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  47.37 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  54.9 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  44.83 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  43.86 
 
 
73 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  47.62 
 
 
81 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  42.62 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1717  ATP synthase F0, C subunit  55.26 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000377801  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  47.17 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1230  ATP synthase F0, C subunit  54.76 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  42.11 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4245  F0F1 ATP synthase subunit C  44.68 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000128569  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  47.17 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  47.17 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.45 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  47.17 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  51.06 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  43.55 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  44.64 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  40.35 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  44.44 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  41.94 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  41.94 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  41.94 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  41.94 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  40.35 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  40.98 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03045  hypothetical protein  56.25 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  40.43 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  37.74 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  43.18 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  43.18 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.37 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  40.35 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  42.5 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
82 aa  40  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  41.3 
 
 
82 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>