More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1480 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  100 
 
 
312 aa  637  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.69227e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  99.68 
 
 
312 aa  637  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.12726e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  100 
 
 
312 aa  637  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.77642e-05  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  637  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  100 
 
 
312 aa  637  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.43379e-07  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  99.68 
 
 
312 aa  634  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.74355e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  100 
 
 
312 aa  637  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.19891e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  100 
 
 
312 aa  637  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  100 
 
 
312 aa  637  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  1.4871e-08 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  98.4 
 
 
312 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  4.93552e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  98.4 
 
 
312 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.49505e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  98.4 
 
 
312 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  98.4 
 
 
312 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  98.4 
 
 
312 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  96.15 
 
 
312 aa  596  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  90.71 
 
 
312 aa  591  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  90.38 
 
 
312 aa  585  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 
313 aa  571  1e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  4.83919e-07 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  90.71 
 
 
312 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 
312 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 
312 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.85688e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 
312 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  90.06 
 
 
312 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  49.36 
 
 
317 aa  299  5e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  49.16 
 
 
324 aa  283  2e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  47.08 
 
 
323 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 
325 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  45.16 
 
 
313 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  43.37 
 
 
313 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  45.42 
 
 
315 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 
315 aa  236  5e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  46.23 
 
 
315 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  44.81 
 
 
314 aa  233  4e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  44.37 
 
 
315 aa  232  8e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  45.57 
 
 
315 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  46.53 
 
 
308 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  45.27 
 
 
313 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  43.92 
 
 
313 aa  221  2e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  44.34 
 
 
306 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  37.58 
 
 
316 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  40.51 
 
 
322 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  37.34 
 
 
318 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  38.62 
 
 
318 aa  201  1e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  43.61 
 
 
327 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  42.37 
 
 
318 aa  190  3e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  39.48 
 
 
317 aa  184  1e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  40.45 
 
 
315 aa  183  4e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  44.15 
 
 
328 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  34.85 
 
 
311 aa  175  1e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  42.91 
 
 
328 aa  174  2e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  42.91 
 
 
328 aa  173  4e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 
310 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.36585e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  34.2 
 
 
315 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.10184e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  35.9 
 
 
326 aa  165  1e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  38.68 
 
 
318 aa  164  2e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  36.69 
 
 
322 aa  162  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  31.95 
 
 
308 aa  160  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  34.96 
 
 
330 aa  154  3e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  31.53 
 
 
305 aa  153  3e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 
308 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  6.7569e-09 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  32.46 
 
 
302 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  30.94 
 
 
310 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  38.74 
 
 
313 aa  147  2e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.33 
 
 
315 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33.66 
 
 
312 aa  147  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  34.52 
 
 
321 aa  146  4e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  29.22 
 
 
311 aa  146  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
306 aa  145  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 
316 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  30.49 
 
 
304 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  35.5 
 
 
349 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 
308 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.63995e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  34.38 
 
 
310 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  28.2 
 
 
306 aa  142  5e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  35.58 
 
 
314 aa  141  2e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  29.51 
 
 
307 aa  140  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  33.22 
 
 
319 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 
319 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  31.16 
 
 
302 aa  138  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  33.69 
 
 
303 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.66616e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  33.2 
 
 
303 aa  135  1e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  34.98 
 
 
303 aa  135  1e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  30.69 
 
 
307 aa  134  2e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.96 
 
 
307 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.56 
 
 
303 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  31.3 
 
 
311 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33.2 
 
 
303 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  30.07 
 
 
310 aa  132  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  30.39 
 
 
310 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  35.25 
 
 
314 aa  132  8e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  32.43 
 
 
303 aa  132  8e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  32.43 
 
 
303 aa  132  8e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.54533e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  32.43 
 
 
303 aa  132  8e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.05 
 
 
303 aa  131  1e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  32.43 
 
 
303 aa  132  1e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.70139e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  30.39 
 
 
310 aa  131  1e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  33.2 
 
 
303 aa  131  1e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  31.71 
 
 
306 aa  131  1e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  31.71 
 
 
306 aa  131  1e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  33.08 
 
 
306 aa  131  2e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>