More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0063 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  99.52 
 
 
207 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  96.14 
 
 
207 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  96.14 
 
 
207 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  96.14 
 
 
207 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  96.14 
 
 
207 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  96.14 
 
 
207 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  94.69 
 
 
207 aa  407  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  87.92 
 
 
207 aa  374  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  88.89 
 
 
207 aa  374  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  86.96 
 
 
207 aa  373  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  87.44 
 
 
207 aa  373  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  87.92 
 
 
207 aa  374  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  88.41 
 
 
207 aa  362  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4209  guanylate kinase  86.47 
 
 
207 aa  350  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4492  guanylate kinase  85.99 
 
 
207 aa  346  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  68.78 
 
 
210 aa  295  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  66.18 
 
 
207 aa  293  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  67.8 
 
 
207 aa  292  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  67.8 
 
 
224 aa  291  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  67.32 
 
 
207 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  66.99 
 
 
207 aa  290  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  66.83 
 
 
210 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  66.83 
 
 
210 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  66.83 
 
 
210 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  66.99 
 
 
207 aa  289  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  2.50462e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  66.83 
 
 
210 aa  288  5e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3777e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  66.83 
 
 
224 aa  288  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  66.18 
 
 
229 aa  287  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  65.53 
 
 
207 aa  287  9e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  65.7 
 
 
207 aa  287  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  66.34 
 
 
207 aa  286  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  66.83 
 
 
207 aa  284  7e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  64.25 
 
 
207 aa  283  2e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  65.05 
 
 
207 aa  281  5e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  63.41 
 
 
207 aa  278  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  64.04 
 
 
207 aa  275  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  61.95 
 
 
206 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  63.9 
 
 
218 aa  265  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  61.72 
 
 
213 aa  265  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0110  guanylate kinase  61.39 
 
 
204 aa  264  7e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  61.46 
 
 
206 aa  264  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  60.49 
 
 
206 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  6.95034e-05 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  61.35 
 
 
212 aa  262  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  60.98 
 
 
206 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  62.56 
 
 
203 aa  261  5e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  62.07 
 
 
203 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  59.22 
 
 
204 aa  255  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  57.64 
 
 
225 aa  252  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  60.1 
 
 
205 aa  251  4e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  59.51 
 
 
205 aa  251  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  56.73 
 
 
215 aa  246  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  59.51 
 
 
206 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  58.25 
 
 
210 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  57.84 
 
 
216 aa  244  6e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  60.73 
 
 
203 aa  243  1e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  57.89 
 
 
214 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0211  guanylate kinase  56.94 
 
 
214 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  53.73 
 
 
205 aa  229  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  54.41 
 
 
208 aa  228  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  53.92 
 
 
207 aa  228  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  56.37 
 
 
211 aa  228  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1212  guanylate kinase  53.47 
 
 
203 aa  228  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  53.92 
 
 
208 aa  227  8e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  51.71 
 
 
204 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0843  guanylate kinase  54.63 
 
 
204 aa  225  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  53.66 
 
 
210 aa  225  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  53.17 
 
 
209 aa  224  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3260  guanylate kinase  54.15 
 
 
221 aa  224  9e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  54.63 
 
 
204 aa  221  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  54.15 
 
 
215 aa  219  2e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  51.98 
 
 
202 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  55.17 
 
 
209 aa  218  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02367  guanylate kinase  54.68 
 
 
203 aa  217  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  51.74 
 
 
210 aa  216  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1992  guanylate kinase  50.74 
 
 
209 aa  214  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1987  guanylate kinase  50.74 
 
 
209 aa  214  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  53.61 
 
 
204 aa  214  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  54.69 
 
 
212 aa  213  1e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  52.74 
 
 
221 aa  212  3e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  52.22 
 
 
202 aa  212  4e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  52.24 
 
 
221 aa  211  8e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  52.24 
 
 
216 aa  211  8e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  52.74 
 
 
216 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1956  guanylate kinase  52.22 
 
 
221 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.414906 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  52.2 
 
 
212 aa  210  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  52.2 
 
 
212 aa  210  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16826e-06 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  52.82 
 
 
218 aa  208  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  49.75 
 
 
227 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3049  guanylate kinase  49.75 
 
 
227 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  49.75 
 
 
227 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  49.75 
 
 
227 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  49.75 
 
 
227 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>