71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3893 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0140  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  99.64 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3952  hypothetical protein  99.64 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3893  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03373  hypothetical protein  99.64 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03422  hypothetical protein  99.64 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0144  hypothetical protein  99.64 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3773  hypothetical protein  99.64 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4066  hypothetical protein  99.27 
 
 		 274 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4946  hypothetical protein  99.27 
 
 		 274 aa  564  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.481244  normal  0.092226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3877  hypothetical protein  89.78 
 
 		 307 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4046  hypothetical protein  89.78 
 
 		 307 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3941  hypothetical protein  89.78 
 
 		 307 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3986  hypothetical protein  89.78 
 
 		 307 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3860  hypothetical protein  89.78 
 
 		 307 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0151  hypothetical protein  82.01 
 
 		 278 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2496  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  41.31 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2061  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.68 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1947  bax protein, putative  32.96 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2413  Bax protein, putative  34.01 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2226  Bax protein, putative  33.78 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2018  bax protein, putative  34.25 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2119  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.25 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1957  bax protein, putative  34.25 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2213  bax protein, putative  35.16 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2158  bax protein, putative  35.16 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0789235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2208  bax protein, putative  35.16 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000122169  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4499  hypothetical protein  35.16 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2226  bax protein, putative  35.16 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  normal  0.0812518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2352  bax protein, putative  34.72 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1997  bax protein, putative  34.21 
 
 		 290 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.300884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3496  lysozyme subfamily protein  33.48 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2691  hypothetical protein  31.4 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2223  Bax protein, putative  35.22 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003479  putative Bax protein  33.95 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2022  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.73 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1803  bax protein, putative  31.56 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1041  putative bax protein  34.72 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2975  putative bax protein  34.56 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03942  uncharacterized FlgJ-related protein  32.83 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02291  hypothetical protein  33.95 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0400  bax protein, putative  36.57 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.342974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2128  hypothetical protein  31.69 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3912  hypothetical protein  31.35 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3701  bax protein, putative  34.8 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1243  putative exported amidase  29.46 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0684  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.13 
 
 		 320 aa  99.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0161528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1578  putative lipoprotein  29.82 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.690527  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0978  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  31.16 
 
 		 354 aa  96.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00771467  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2111  transcriptional regulator, Fis family protein  34.3 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  normal  0.43033 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1179  hypothetical protein  30.28 
 
 		 330 aa  95.5  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0417  BAX protein  29.91 
 
 		 322 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0872  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  32.66 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4482  Bax domain-containing protein  30.69 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3268  BAX protein  33.17 
 
 		 307 aa  93.2  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3159  uncharacterized FlgJ-related protein-like  33.16 
 
 		 353 aa  92.8  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0422  BAX protein  33.07 
 
 		 174 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0073  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.3 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1770  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  34.01 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1517  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  38.66 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1885  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  39.13 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1703  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  38.66 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00443549  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1338  hypothetical protein  29.94 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0055  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain protein  29.92 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4894  hypothetical protein  27.42 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2235  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  55.56 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3400  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.31 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02068  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.51 
 
 		 74 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0379414  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1329  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  31.25 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2771  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  50 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.133297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0076  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.4 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>