65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0872 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0872  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  100 
 
 		 342 aa  699    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0978  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  65.44 
 
 		 354 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00771467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3159  uncharacterized FlgJ-related protein-like  65.63 
 
 		 353 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2111  transcriptional regulator, Fis family protein  65.53 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  normal  0.43033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4482  Bax domain-containing protein  67.92 
 
 		 297 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3701  bax protein, putative  57 
 
 		 301 aa  346  4e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0684  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  59.33 
 
 		 320 aa  342  5e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0161528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3496  lysozyme subfamily protein  44.33 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03942  uncharacterized FlgJ-related protein  43.9 
 
 		 250 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2691  hypothetical protein  43.2 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2128  hypothetical protein  42.16 
 
 		 294 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0400  bax protein, putative  41.9 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.342974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1578  putative lipoprotein  38.68 
 
 		 245 aa  142  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.690527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1179  hypothetical protein  35.98 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2119  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.62 
 
 		 270 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2018  bax protein, putative  34.62 
 
 		 270 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1957  bax protein, putative  34.62 
 
 		 270 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2223  Bax protein, putative  42.79 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2022  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  38.65 
 
 		 272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2061  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  39.71 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2226  Bax protein, putative  41.18 
 
 		 275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0417  BAX protein  30.7 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1997  bax protein, putative  40.69 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.300884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2413  Bax protein, putative  39.72 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2226  bax protein, putative  37.75 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  normal  0.0812518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2158  bax protein, putative  37.75 
 
 		 270 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0789235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2213  bax protein, putative  37.75 
 
 		 270 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4499  hypothetical protein  37.75 
 
 		 270 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2208  bax protein, putative  37.75 
 
 		 270 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000122169  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2352  bax protein, putative  39.9 
 
 		 255 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1947  bax protein, putative  39.22 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1041  putative bax protein  37.91 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2975  putative bax protein  40 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02291  hypothetical protein  35.78 
 
 		 278 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1803  bax protein, putative  35.21 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003479  putative Bax protein  36.19 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1243  putative exported amidase  31.03 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3268  BAX protein  32.73 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3912  hypothetical protein  38.86 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0422  BAX protein  39.87 
 
 		 174 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0073  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  36.41 
 
 		 239 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0055  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain protein  32.09 
 
 		 235 aa  99  9e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1338  hypothetical protein  29.84 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1517  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  31.02 
 
 		 243 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4066  hypothetical protein  33.67 
 
 		 274 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3773  hypothetical protein  33.17 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03422  hypothetical protein  33.17 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0140  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.17 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03373  hypothetical protein  33.17 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4946  hypothetical protein  33.17 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.481244  normal  0.092226 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2496  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.32 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3952  hypothetical protein  33.17 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0144  hypothetical protein  33.17 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1885  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  28.63 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1703  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  31.02 
 
 		 243 aa  94  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00443549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0151  hypothetical protein  33.17 
 
 		 278 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3893  hypothetical protein  32.66 
 
 		 274 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1770  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  36.84 
 
 		 223 aa  93.2  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3986  hypothetical protein  32.18 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3860  hypothetical protein  32.18 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3877  hypothetical protein  32.18 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4046  hypothetical protein  32.18 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3941  hypothetical protein  32.18 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4894  hypothetical protein  25.12 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02068  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  48.61 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0379414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>