66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2226 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2226  Bax protein, putative  100 
 
 
275 aa  564  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2223  Bax protein, putative  62.36 
 
 
275 aa  374  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2413  Bax protein, putative  63.1 
 
 
275 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1997  bax protein, putative  60.58 
 
 
290 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.300884  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2226  bax protein, putative  55.43 
 
 
270 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  normal  0.0812518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2158  bax protein, putative  55.43 
 
 
270 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0789235  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4499  hypothetical protein  55.43 
 
 
270 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2213  bax protein, putative  55.43 
 
 
270 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2208  bax protein, putative  55.43 
 
 
270 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000122169  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2018  bax protein, putative  56.02 
 
 
270 aa  319  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2119  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  56.02 
 
 
270 aa  319  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0221355 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1947  bax protein, putative  53.93 
 
 
270 aa  318  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1957  bax protein, putative  56.02 
 
 
270 aa  317  9e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2352  bax protein, putative  55.78 
 
 
255 aa  299  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2022  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  54.1 
 
 
272 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1803  bax protein, putative  46.3 
 
 
290 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2975  putative bax protein  47.22 
 
 
293 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2061  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  48.02 
 
 
286 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1578  putative lipoprotein  44.09 
 
 
245 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.690527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1041  putative bax protein  42.61 
 
 
267 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0400  bax protein, putative  42.79 
 
 
259 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.342974  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3496  lysozyme subfamily protein  41.99 
 
 
288 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003479  putative Bax protein  44.55 
 
 
237 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02291  hypothetical protein  40.08 
 
 
278 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2691  hypothetical protein  42.6 
 
 
310 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2128  hypothetical protein  40.09 
 
 
294 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03942  uncharacterized FlgJ-related protein  42.47 
 
 
250 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3912  hypothetical protein  39.91 
 
 
304 aa  159  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1179  hypothetical protein  38.07 
 
 
330 aa  146  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2496  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  41.23 
 
 
293 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0978  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  42.06 
 
 
354 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00771467  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4066  hypothetical protein  34.67 
 
 
274 aa  135  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0144  hypothetical protein  34.22 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3952  hypothetical protein  34.22 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4946  hypothetical protein  34.22 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.481244  normal  0.092226 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03373  hypothetical protein  34.22 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0140  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.22 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03422  hypothetical protein  34.22 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3773  hypothetical protein  34.22 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3893  hypothetical protein  33.78 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3986  hypothetical protein  32.89 
 
 
307 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0073  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  36.65 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4046  hypothetical protein  32.89 
 
 
307 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3877  hypothetical protein  32.89 
 
 
307 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3860  hypothetical protein  32.89 
 
 
307 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3941  hypothetical protein  32.89 
 
 
307 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0872  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  41.18 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4482  Bax domain-containing protein  38.5 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0151  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0684  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.85 
 
 
320 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0161528  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3159  uncharacterized FlgJ-related protein-like  39.81 
 
 
353 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3701  bax protein, putative  34.43 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2111  transcriptional regulator, Fis family protein  38.36 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  normal  0.43033 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1770  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  29.91 
 
 
223 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0417  BAX protein  32.16 
 
 
322 aa  99.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1338  hypothetical protein  39.84 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1243  putative exported amidase  32 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1517  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  29.2 
 
 
243 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1703  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  27.71 
 
 
243 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00443549  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3268  BAX protein  35.44 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0055  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain protein  28.29 
 
 
235 aa  92  9e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359095  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1885  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  28.32 
 
 
244 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0422  BAX protein  34.93 
 
 
174 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4894  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02068  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  44.59 
 
 
74 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0379414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02069  uncharacterized FlgJ-related protein  31.25 
 
 
150 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0320569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>