66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4894 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4894  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1179  hypothetical protein  31.75 
 
 		 330 aa  92.4  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03942  uncharacterized FlgJ-related protein  31.03 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0684  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.18 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0161528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3701  bax protein, putative  30.33 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1578  putative lipoprotein  30.42 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.690527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1338  hypothetical protein  31.63 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3496  lysozyme subfamily protein  27.48 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003479  putative Bax protein  29.76 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4482  Bax domain-containing protein  30.29 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2061  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.71 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2111  transcriptional regulator, Fis family protein  30 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.951323  normal  0.43033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2975  putative bax protein  29.06 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1803  bax protein, putative  29.72 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02291  hypothetical protein  33.86 
 
 		 278 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1885  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  35.88 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1517  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  35.88 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2691  hypothetical protein  26.7 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1770  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  32.59 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1703  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  35.88 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00443549  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0978  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  25.12 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00771467  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1041  putative bax protein  32.81 
 
 		 267 aa  72  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0872  uncharacterized FlgJ-related protein-like protein  25.12 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2128  hypothetical protein  33.85 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3912  hypothetical protein  30.71 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3159  uncharacterized FlgJ-related protein-like  25.84 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0400  bax protein, putative  34.15 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.342974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2413  Bax protein, putative  31.43 
 
 		 275 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2208  bax protein, putative  33.06 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000122169  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2158  bax protein, putative  33.06 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0789235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2226  bax protein, putative  33.06 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  normal  0.0812518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2213  bax protein, putative  33.06 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0162368  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4499  hypothetical protein  33.06 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0055  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain protein  35.38 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1997  bax protein, putative  24.22 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.300884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1947  bax protein, putative  32.82 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1957  bax protein, putative  28.98 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2018  bax protein, putative  28.98 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2119  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.98 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2223  Bax protein, putative  31.39 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2496  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  26.56 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2352  bax protein, putative  31.75 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2226  Bax protein, putative  25 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2022  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.9 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29202  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0073  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.09 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1243  putative exported amidase  23.32 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0151  hypothetical protein  28.23 
 
 		 278 aa  52.4  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3268  BAX protein  23.64 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3773  hypothetical protein  27.42 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03422  hypothetical protein  27.42 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0140  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.42 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03373  hypothetical protein  27.42 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4946  hypothetical protein  27.42 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.481244  normal  0.092226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4046  hypothetical protein  27.42 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3877  hypothetical protein  27.42 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3860  hypothetical protein  27.42 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3986  hypothetical protein  27.42 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3941  hypothetical protein  27.42 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3952  hypothetical protein  27.42 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0144  hypothetical protein  27.42 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3893  hypothetical protein  27.42 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4066  hypothetical protein  26.61 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3400  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.77 
 
 		 157 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.78201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02068  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  36.11 
 
 		 74 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0379414  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0417  BAX protein  26.03 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1812  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.31 
 
 		 197 aa  42  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0555239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>