More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1836 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  99.57 
 
 
231 aa  471  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
231 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.8735e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
231 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  100 
 
 
231 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  99.13 
 
 
231 aa  470  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  99.13 
 
 
231 aa  468  1e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  99.13 
 
 
231 aa  468  1e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  98.27 
 
 
231 aa  465  1e-130  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  96.97 
 
 
231 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  85.28 
 
 
231 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  85.28 
 
 
231 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  85.28 
 
 
231 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  85.28 
 
 
231 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  85.28 
 
 
231 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  80.87 
 
 
231 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  70 
 
 
233 aa  337  7e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  71.18 
 
 
232 aa  328  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  71.18 
 
 
232 aa  328  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  71.18 
 
 
232 aa  328  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  67.39 
 
 
233 aa  326  2e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  68.7 
 
 
233 aa  325  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  67.83 
 
 
233 aa  323  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  65.5 
 
 
233 aa  317  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  55.65 
 
 
233 aa  261  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  56.71 
 
 
233 aa  259  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  54.66 
 
 
237 aa  254  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  52.81 
 
 
233 aa  254  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  51.33 
 
 
232 aa  233  1e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  46.44 
 
 
239 aa  221  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  51.53 
 
 
236 aa  218  9e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  46.81 
 
 
237 aa  211  6e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  44.64 
 
 
239 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  49.37 
 
 
234 aa  204  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  48.48 
 
 
234 aa  202  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  44.03 
 
 
247 aa  198  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  48.03 
 
 
237 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  48.03 
 
 
237 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  46.19 
 
 
233 aa  198  8e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  48.03 
 
 
237 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  48.03 
 
 
237 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  48.66 
 
 
224 aa  197  1e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  45.89 
 
 
238 aa  197  1e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  47.77 
 
 
226 aa  197  1e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  48.26 
 
 
227 aa  197  1e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  48.03 
 
 
236 aa  196  2e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  47.26 
 
 
236 aa  196  2e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  47.77 
 
 
224 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  43.72 
 
 
239 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  46.41 
 
 
238 aa  196  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  46.67 
 
 
224 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  46.72 
 
 
236 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  47.16 
 
 
236 aa  195  5e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  47.6 
 
 
236 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  48.66 
 
 
224 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  48.21 
 
 
224 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  47.58 
 
 
226 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  45.37 
 
 
228 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  47.16 
 
 
236 aa  191  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  45.54 
 
 
224 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  44 
 
 
224 aa  184  1e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  46.4 
 
 
266 aa  178  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  42.42 
 
 
235 aa  173  3e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  44.74 
 
 
228 aa  168  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  43.46 
 
 
233 aa  167  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  44.25 
 
 
225 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  46.67 
 
 
229 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  38.18 
 
 
226 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  37.12 
 
 
226 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  43.17 
 
 
229 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  39.57 
 
 
237 aa  153  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  41.13 
 
 
237 aa  153  3e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  43.81 
 
 
229 aa  152  3e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  40.26 
 
 
231 aa  151  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  42.92 
 
 
229 aa  151  9e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  3.81298e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  37.83 
 
 
235 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  2.68833e-06 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  41.56 
 
 
239 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1731  peptidase M22, glycoprotease  40.27 
 
 
220 aa  148  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.978366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  38.75 
 
 
233 aa  147  1e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  38.7 
 
 
223 aa  145  4e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  35.42 
 
 
230 aa  130  2e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  1.26844e-09 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  36.89 
 
 
223 aa  129  4e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2257  peptidase M22 glycoprotease  34.96 
 
 
230 aa  127  1e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  44.97 
 
 
222 aa  125  4e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  44.97 
 
 
222 aa  125  4e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1232  peptidase M22 glycoprotease  36.21 
 
 
255 aa  125  4e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  0.181812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  38.96 
 
 
246 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2045  peptidase M22, glycoprotease  35.78 
 
 
255 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6032  peptidase M22, glycoprotease  35.78 
 
 
255 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.827723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2077  peptidase M22, glycoprotease  36.21 
 
 
255 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1946  peptidase M22 glycoprotease  36.21 
 
 
255 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  35.71 
 
 
239 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  35.68 
 
 
267 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  43.21 
 
 
276 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2064  peptidase M22 glycoprotease  35.78 
 
 
255 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  38.63 
 
 
243 aa  121  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5354  peptidase M22, glycoprotease  35.34 
 
 
255 aa  120  1e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1939  peptidase M22, glycoprotease  38.91 
 
 
282 aa  121  1e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1365  peptidase M22 glycoprotease  33.74 
 
 
279 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  33.93 
 
 
223 aa  118  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2465  glycoprotease family protein  36.44 
 
 
249 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>