14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02821 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02821  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  775    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000136217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02771  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  775    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000264009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5667  hypothetical protein  31.72 
 
 		 551 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1350  hypothetical protein  23.18 
 
 		 608 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26490  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  28.75 
 
 		 586 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02826  hypothetical protein  29.41 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02775  hypothetical protein  29.41 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000201247  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26390  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  24.87 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5666  hypothetical protein  26.39 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1678  hypothetical protein  25.17 
 
 		 564 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193325  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1683  hypothetical protein  25.17 
 
 		 564 aa  59.7  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26400  hypothetical protein  26 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.966335  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1844  hypothetical protein  30.14 
 
 		 581 aa  57  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.225555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1843  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.63 
 
 		 588 aa  54.3  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.426283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>