14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02821 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02821  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  775  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.36217e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02771  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  775  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.64009e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5667  hypothetical protein  31.72 
 
 
551 aa  70.1  6e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1350  hypothetical protein  23.18 
 
 
608 aa  69.7  7e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26490  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  28.75 
 
 
586 aa  65.9  1e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02826  hypothetical protein  29.41 
 
 
458 aa  64.7  3e-09  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.63468e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02775  hypothetical protein  29.41 
 
 
438 aa  64.3  4e-09  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.01247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26390  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  24.87 
 
 
419 aa  63.9  5e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5666  hypothetical protein  26.39 
 
 
569 aa  60.5  5e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1678  hypothetical protein  25.17 
 
 
564 aa  60.1  7e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193325  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1683  hypothetical protein  25.17 
 
 
564 aa  59.7  8e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26400  hypothetical protein  26 
 
 
576 aa  58.2  2e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.966335  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1844  hypothetical protein  30.14 
 
 
581 aa  57  6e-07  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.225555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1843  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.63 
 
 
588 aa  54.3  4e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.426283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>