65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1631 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  773  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  57.71 
 
 
381 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  51.32 
 
 
371 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  47.01 
 
 
378 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2318  hypothetical protein  33.51 
 
 
371 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575561 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  30.18 
 
 
530 aa  131  2e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  28.72 
 
 
611 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  28.18 
 
 
467 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  29.92 
 
 
461 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  27.23 
 
 
542 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  28.88 
 
 
546 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  25.95 
 
 
622 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  5.79847e-05  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  25.13 
 
 
463 aa  97.1  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  24.84 
 
 
467 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  28.89 
 
 
545 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  29.22 
 
 
455 aa  89.7  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  26.22 
 
 
546 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  25.41 
 
 
532 aa  87  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  25.56 
 
 
656 aa  86.3  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  23.81 
 
 
462 aa  84.3  3e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  25.86 
 
 
728 aa  83.2  8e-15  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  24.36 
 
 
459 aa  80.1  5e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.75912e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  28.63 
 
 
527 aa  80.5  5e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  25.88 
 
 
634 aa  79.7  8e-14  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  30.08 
 
 
455 aa  79.7  8e-14  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  26.34 
 
 
653 aa  78.2  2e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  23.68 
 
 
530 aa  78.2  2e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  25.47 
 
 
544 aa  78.6  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  3.93022e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  24.06 
 
 
660 aa  76.3  1e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.13292e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  25.2 
 
 
456 aa  73.2  8e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  24.54 
 
 
529 aa  73.2  8e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  25 
 
 
538 aa  69.7  9e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  26.4 
 
 
563 aa  68.2  2e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  26.43 
 
 
556 aa  68.6  2e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  29.55 
 
 
563 aa  67.4  4e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  29.55 
 
 
563 aa  67.4  4e-10  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  29.55 
 
 
563 aa  67.4  4e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  24.73 
 
 
541 aa  66.2  8e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  30.41 
 
 
555 aa  65.1  2e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  21.18 
 
 
525 aa  65.1  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  24.66 
 
 
556 aa  64.3  3e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  23.73 
 
 
462 aa  63.9  4e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  23.56 
 
 
554 aa  62.4  1e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  29.49 
 
 
562 aa  61.6  2e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  29.11 
 
 
509 aa  62  2e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  26.38 
 
 
501 aa  60.8  3e-08  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  24.29 
 
 
555 aa  60.5  4e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  25.92 
 
 
556 aa  60.5  5e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  27.06 
 
 
629 aa  58.2  3e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  24.6 
 
 
556 aa  57  5e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  28.3 
 
 
562 aa  57  5e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  28.3 
 
 
562 aa  57.4  5e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04321e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  28.3 
 
 
562 aa  57  5e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  23.31 
 
 
562 aa  56.6  7e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  28.3 
 
 
562 aa  56.2  8e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  25.39 
 
 
534 aa  56.2  9e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  22.56 
 
 
578 aa  53.9  5e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  22.07 
 
 
552 aa  53.1  8e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  23.02 
 
 
556 aa  52  2e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  29.73 
 
 
603 aa  50.8  4e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  26.1 
 
 
484 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  22.62 
 
 
565 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  25.47 
 
 
520 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  23.76 
 
 
562 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  23.19 
 
 
603 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>