More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1193 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  57.21 
 
 		 633 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3061  ABC transporter related  64.86 
 
 		 663 aa  768    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0828579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  57.46 
 
 		 641 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2477  ATPase  60.09 
 
 		 645 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367976  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1193  ABC transporter related  100 
 
 		 641 aa  1280    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280066  decreased coverage  0.00112176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  54.26 
 
 		 594 aa  621  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0384  ABC transporter related  56.11 
 
 		 628 aa  615  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  54.52 
 
 		 623 aa  611  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  55.54 
 
 		 631 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  55.18 
 
 		 643 aa  610  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  51.16 
 
 		 641 aa  602  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1686  ABC transporter related  53.3 
 
 		 625 aa  601  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.750234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0171  ABC transporter-related protein  51 
 
 		 639 aa  595  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  53.04 
 
 		 635 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  48.37 
 
 		 637 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  48.37 
 
 		 637 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  47.92 
 
 		 642 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  48.37 
 
 		 637 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  48.99 
 
 		 640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  49.62 
 
 		 645 aa  575  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  46.07 
 
 		 653 aa  567  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  49.84 
 
 		 640 aa  566  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  51.92 
 
 		 637 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  51.69 
 
 		 650 aa  568  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  48.93 
 
 		 642 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  48.44 
 
 		 639 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  52.96 
 
 		 615 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  46.41 
 
 		 647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  47.69 
 
 		 639 aa  561  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  50.15 
 
 		 649 aa  560  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  51.88 
 
 		 639 aa  555  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  51.65 
 
 		 627 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 641 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  49.53 
 
 		 635 aa  558  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1011  ABC transporter related  50.39 
 
 		 636 aa  558  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.954717  normal  0.0514719 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  47.52 
 
 		 632 aa  555  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  45.18 
 
 		 617 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  49.61 
 
 		 635 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  51.57 
 
 		 623 aa  552  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 		 646 aa  549  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  48.53 
 
 		 638 aa  551  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  49.69 
 
 		 642 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  49.23 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  45.74 
 
 		 648 aa  549  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  48.38 
 
 		 642 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1987  hypothetical protein  44.55 
 
 		 617 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  45.74 
 
 		 648 aa  547  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  50 
 
 		 635 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  48.38 
 
 		 642 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  49.77 
 
 		 634 aa  548  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  48.07 
 
 		 642 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 		 635 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 		 635 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  49.53 
 
 		 635 aa  543  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 		 635 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  49.53 
 
 		 635 aa  543  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  49.69 
 
 		 635 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  49.23 
 
 		 637 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  49.84 
 
 		 635 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  50 
 
 		 641 aa  545  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.712623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  49.37 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  49.47 
 
 		 660 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  50.93 
 
 		 639 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  49.37 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  49.37 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 		 648 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 		 648 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  49.47 
 
 		 660 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 		 648 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 		 660 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  49.37 
 
 		 635 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  49.01 
 
 		 649 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  49.38 
 
 		 637 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  46.28 
 
 		 640 aa  538  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  48.92 
 
 		 640 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1572  ABC transporter related  51.96 
 
 		 603 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  49.31 
 
 		 648 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  46.55 
 
 		 641 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  46.55 
 
 		 641 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  48.08 
 
 		 645 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  47.25 
 
 		 641 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  46.55 
 
 		 641 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  46.55 
 
 		 641 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  49 
 
 		 636 aa  538  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  46.09 
 
 		 640 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  48.91 
 
 		 636 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  48.29 
 
 		 636 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  48.77 
 
 		 646 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  49.53 
 
 		 631 aa  534  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 1065 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  47.79 
 
 		 649 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  48.7 
 
 		 649 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  46.3 
 
 		 641 aa  535  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  45.94 
 
 		 640 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  47.87 
 
 		 648 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  45.99 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  48.24 
 
 		 661 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  48.24 
 
 		 661 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  48.05 
 
 		 636 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>