273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0597 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  70.4 
 
 		 224 aa  289  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  62.79 
 
 		 211 aa  257  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  59.91 
 
 		 210 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  60.65 
 
 		 211 aa  256  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  61.86 
 
 		 211 aa  254  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  61.11 
 
 		 210 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  60.65 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  60.65 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  60.65 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  60.65 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  60.65 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  60.65 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  60.93 
 
 		 212 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  59.72 
 
 		 210 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  59.72 
 
 		 210 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  59.72 
 
 		 210 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  60 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  60 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  59.26 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  59.26 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  59.26 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  58.41 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  59.72 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  61.86 
 
 		 212 aa  246  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  58.8 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  52.53 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  59.07 
 
 		 210 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  57.87 
 
 		 210 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  57.87 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  56.34 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  57.21 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  57.87 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  57.87 
 
 		 211 aa  241  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  62.5 
 
 		 211 aa  241  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  59.72 
 
 		 210 aa  241  9e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  57.87 
 
 		 209 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  55.35 
 
 		 210 aa  238  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  59.53 
 
 		 211 aa  238  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  56.74 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  58.72 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  58.72 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  58.6 
 
 		 210 aa  235  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  57.41 
 
 		 211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  61.4 
 
 		 211 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  56.28 
 
 		 210 aa  234  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  56.74 
 
 		 210 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  61.57 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  60.19 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  51.61 
 
 		 216 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  59.72 
 
 		 210 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  57.67 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  55.71 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  54.55 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  55.35 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  55.09 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  57.21 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  54.42 
 
 		 211 aa  221  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  50.63 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  55.09 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  58.8 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  57.6 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  52.58 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  53.24 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  59.72 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  57.84 
 
 		 198 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  51.85 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  43.9 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  39.91 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  35.91 
 
 		 197 aa  108  8.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  31.7 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  32.88 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  32.46 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  31.95 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  32.38 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  31.54 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  32.78 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  30.74 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  30.74 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  32.37 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  29.49 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  30.74 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  31.97 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  30.74 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  30.74 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  33.19 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  28.07 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  32.07 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  28.99 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  28.07 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  32.93 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  34.33 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  31.95 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  31.95 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  31.95 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  30.17 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>