More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1796 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  100 
 
 
581 aa  1170    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  47.77 
 
 
582 aa  558  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  48.8 
 
 
580 aa  552  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  48.71 
 
 
585 aa  552  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  47.86 
 
 
586 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  48.98 
 
 
588 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  48.02 
 
 
578 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  47.25 
 
 
583 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  45.33 
 
 
580 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  47.42 
 
 
583 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  46.23 
 
 
585 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  46.23 
 
 
585 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  46.23 
 
 
585 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  46.23 
 
 
585 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  46.23 
 
 
585 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  46.58 
 
 
585 aa  534  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  46.23 
 
 
585 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  49.06 
 
 
584 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  46.23 
 
 
585 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  46.4 
 
 
585 aa  531  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  45.89 
 
 
585 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  45.72 
 
 
585 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  45.7 
 
 
583 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  47.44 
 
 
587 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  45.36 
 
 
587 aa  513  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  46.39 
 
 
577 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  45.36 
 
 
582 aa  511  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  46.9 
 
 
601 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  45.16 
 
 
594 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  44.35 
 
 
585 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  44.66 
 
 
592 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  44.66 
 
 
592 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  45.06 
 
 
600 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  44.27 
 
 
590 aa  490  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  45.12 
 
 
580 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  45.44 
 
 
605 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  44.83 
 
 
590 aa  484  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  46.64 
 
 
596 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  44.14 
 
 
589 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  46.3 
 
 
596 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  42.64 
 
 
585 aa  474  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  43.15 
 
 
585 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  49.79 
 
 
485 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  45.97 
 
 
597 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  43.15 
 
 
585 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  46.47 
 
 
596 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  49.58 
 
 
485 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  42.46 
 
 
582 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  43.92 
 
 
580 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  49.68 
 
 
471 aa  461  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  48.72 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  49.26 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  49.58 
 
 
481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  41.13 
 
 
589 aa  449  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  0.000000000000201084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  49.68 
 
 
472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  49.57 
 
 
471 aa  445  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  48.1 
 
 
481 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  48.09 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  48.1 
 
 
476 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  46.62 
 
 
474 aa  433  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  47.12 
 
 
472 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  45.36 
 
 
474 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  45.15 
 
 
474 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  46.89 
 
 
479 aa  432  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  47.12 
 
 
472 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  48.29 
 
 
478 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  47.5 
 
 
476 aa  425  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  48.31 
 
 
483 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  48.51 
 
 
479 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  44.51 
 
 
477 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  46.15 
 
 
470 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  48.83 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  46.62 
 
 
474 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  46.07 
 
 
478 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  48.82 
 
 
480 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  46.45 
 
 
482 aa  415  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2605  pyruvate kinase  40.07 
 
 
588 aa  413  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  48.17 
 
 
480 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  46.5 
 
 
470 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0844  pyruvate kinase  42.12 
 
 
585 aa  411  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  46.07 
 
 
470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2582  pyruvate kinase  44.82 
 
 
470 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00785837  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  46.44 
 
 
474 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1749  pyruvate kinase  44.82 
 
 
470 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.39981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1855  pyruvate kinase  44.82 
 
 
470 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000869854  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01645  pyruvate kinase  44.61 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000322143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1966  pyruvate kinase  44.61 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000099684  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1793  pyruvate kinase  44.82 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000263395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1520  pyruvate kinase  44.61 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000224591  decreased coverage  0.00000000336273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2390  pyruvate kinase  44.61 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000743671  hitchhiker  0.0000173681 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01635  hypothetical protein  44.61 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000427708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1964  pyruvate kinase  44.82 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000120282  hitchhiker  0.00000000245997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1491  pyruvate kinase  44.82 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0197868  hitchhiker  0.00000000000000413859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  44.44 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  41.86 
 
 
481 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  43.35 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  44.61 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1511  pyruvate kinase  44.82 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00345195  hitchhiker  0.00000000277605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  44.99 
 
 
509 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1757  pyruvate kinase  44.61 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18747e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>