51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1469 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
107 aa  206  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  60.95 
 
 
108 aa  127  4e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  52.04 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2929  branched-chain amino acid transport  52.38 
 
 
111 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.814408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  45.16 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  53.41 
 
 
107 aa  81.6  3e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  44.44 
 
 
95 aa  80.1  8e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  42.31 
 
 
116 aa  76.6  1e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  39.77 
 
 
107 aa  75.5  2e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0923  branched-chain amino acid transport  39.18 
 
 
110 aa  70.9  5e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.327368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  40.4 
 
 
103 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  40.4 
 
 
103 aa  69.7  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  40.4 
 
 
103 aa  69.3  1e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  40.4 
 
 
103 aa  69.7  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  40.4 
 
 
103 aa  69.7  1e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  40.4 
 
 
103 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  39 
 
 
103 aa  67.4  6e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  63.9  7e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  63.9  7e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0349  branched-chain amino acid transport  61.33 
 
 
106 aa  60.5  7e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1392  branched-chain amino acid transport  40 
 
 
103 aa  57.4  6e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  35.05 
 
 
106 aa  52.8  1e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  39.53 
 
 
108 aa  52.8  1e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  41.94 
 
 
100 aa  52.4  2e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1242  branched chain amino acid ABC transporter  48.04 
 
 
105 aa  52.4  2e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  39.53 
 
 
108 aa  52  3e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  40.78 
 
 
107 aa  52  3e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0850  hypothetical protein  26.67 
 
 
109 aa  49.3  2e-05  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000591245  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  35.05 
 
 
109 aa  48.5  3e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  32.97 
 
 
111 aa  48.5  3e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  47.8  5e-05  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  35.56 
 
 
111 aa  47.4  6e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  35.56 
 
 
111 aa  47.4  6e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  34.02 
 
 
108 aa  47  8e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  37.21 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  34.74 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  34.83 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  31.63 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  43.4 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  31.11 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  31.11 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  31.25 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  31.25 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  36.45 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  36.45 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2050  hypothetical protein  34.55 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  27.27 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  30 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  33.71 
 
 
166 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>