22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0449 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  352  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  36.02 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0269  hypothetical protein  34.91 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  33.75 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  35 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0255  hypothetical protein  34.38 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2270  hypothetical protein  33.14 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  30.41 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  35.14 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  35.33 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1949  hypothetical protein  36.15 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.372883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0135  hypothetical protein  29.11 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000621154  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0702  hypothetical protein  29.3 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0036  hypothetical protein  28.48 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  29.38 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  31.62 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0043  hypothetical protein  26.97 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 284 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 288 aa  41.2  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  36.92 
 
 		 279 aa  41.2  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  27.81 
 
 		 285 aa  40.8  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 291 aa  40.8  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>